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간암 세포 cell line에서 qRT-PCR 결과 cell line별로 peak이 달라요
레벨1 ymk8028 (대학원생)
간암세포에서 타겟하는 유전자를 qRT-PCR로 확인하기 위해서 primer로 HCC cell line(Hep3B, Huh7, PLC, SNU423, SNU449, SNU475, SNU368, SNU398)과 NC(MIHA, THLE)로 qRT-PCR 진행했습니다.
그런데 Hep3B, Huh7, PLC, MIHA에서는 증폭이 잘 안되는 2peak이 뜨고 나머지 cell line에서는 1 peak으로 잘 증폭되는 것을 확인했습니다.
또한, 간암조직에서도 qRT-PCR 진행했는데 Tumor에서는 one peeak이 뜨고 non-tumor에서는 증폭이 낮게 2 peak이 나타났습니다.
샘플이 조직일 경우, 조직이라는 특정때문이라고 생각했는데, cell line에서 cell 별고 다른 결과가 나오는 것을 보고 의문이 생겨서요
cell에서 RNA 뽑고 cDNA 합성해서 qRT-PCR 결과, cell 별로 peak이 다르게 나오는 경우가 있나요?
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