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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 pME-18s-FL3 시퀀싱 프라이머
알신삼(대학생)  | 01.14 11:57

안녕하세요!

pME-18s-FL3 vector를 construct로 한 gene을 가지고 있는데요.

Sequencing을 맡기려고 하는데 universal primer를 어떤 것을 사용해야 되는지 잘 모르겠어서요.

1. SV40-pAR이 있는데, 이건 3`에 있는 SV40 poly-A site 를 reverse로 읽어주는 건가요? 5'쪽의 primer는 공통적으로 사용되는게 없나요?

2. 이 vector는 promoter가 뭔가요?

 

감사합니다.

#sequencing
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  01.14 15:43  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

sequencing하려는 insert를 어느 효소자리에 넣었나요?

아니면 vector 어디부터 어디까지 sequencing하나요?

알신삼  |  01.14 17:11  

insert가 어떤 enz cut이었는지 모르는 경우에 보통은 Multicloning site의 앞 뒤에 promoter나 sequencing 용 primer site를 잡아서 읽고 있습니다.

sequencing 분석 업체에서 주로 사용하는 primer site가 있는지 확인해보려고 했는데, MCS 3'쪽의 SV40 poly A site는 primer를 가지고 있었고, 5'쪽은 없는 것 같더라구요. primer 새로 디자인해서 sequencing 해보려고 합니다.

 

대왕개구리SPEED  |  01.14 18:32  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

SV40 ptomoter 안의 서열을 primer로 만들면 될것 같습니다.

한번에 읽기는 힘들것 같고 primer working을 한번 해야지 full 서열을 읽을 수

있을 것 같습니다.

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