[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 sale 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
검색광고안내
과학기술용어에 대한 과기인 인식조사
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 3144  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 primer 깨짐이란게 무슨의민지 궁금합니다!
알뚜야(대학원생)  | 01.13 16:07

제노텍이라는 회사에 sequencing을 primer랑 같이 보냈는데 primer깨짐이 의심된다고 comment가 달렸더라구요..

그래서 제노텍에 물어보았는데 primer를 상온에 오래냅두거나하면 깨질수도있다고하는데 서열분석에는 아무런 지장없이 분석을 할 수 있다고하더라구요

그 깨졌다는게 정확하게 뭔지를 알고싶은데 그쪽 회사에서도 정확한 답변을 안주셔서 너무 답답해서 질문합니당..ㅠㅠ 

#sequencing
 
#primer
 
#sequence
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  01.13 16:19  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

그냥 말그대로 깨져서 분해된 겁니다.

예를 들어 21mer primer가 있다면 분해되어 21mer이하의 random한 크기로

되었다는 뜻입니다.

알뚜야  |  01.13 16:27  

스피드님 감사합니다

근데 primer는 왜 깨지는 현상이 일어나는걸까요?ㅠㅠ

 

대왕개구리SPEED  |  01.13 16:38  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

여러가지가 있을겁니다.

일반적으로는 잘 발생하지 않습니다만 Dnase 오염, 반복적인 냉동 및 해동, 특히

해동 시 높은 온도에서 하는 경우 등 이외에도 많은 원인 있을 겁니다.

하지만 Dnase 오염, 구조적 불안정이 없을 경우 실온에 보관한다고 분해되지는

않습니다.

어떤 분해되는 원인이 발생했을 때 온도가 낮은 것 보다는 높은 것이 분해를

촉진 시키기는 합니다.

대왕개구리강시  |  01.13 20:01  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

primer가 손상을 입어서 염기 몇개가 떨어져 버렸다면 sequencing에 사용하면 안됩니다.

primer의 3' 말단이 손상을 입으면 상관 없으나 5' 말단이 손상을 입으면 엉뚱한 sequencing결과가 나옵니다.

Sanger sequecing이라는 것이 primer에 nucleotide가 결합하면서 길이가 늘어나고 그 하나의 염기차이로 젤 이동속도가 달라져서 sequence를 읽을 수 있는 방법입니다. 그런데 5' 말단이 손상되면 sequence가 하나씩 뒤로 밀리는 결과를 가져옵니다. 그것도 각 primer마다 제거된 염기수가 다르다면 더욱 엉망이 됩니다.

혹시 모르니 primer를 다시 합성해서 사용하는 것을 권합니다.

답변하기
할인행사 광고 검색광고
하나과학 하나과학
Socorex 2020 BIG SALE event - Socorex Acura manual micropipe.. (1.31까지)
케이비티 케이비티
Mixer, Dry Bath, Heating Block, Thermo Shaker, Shaking Incub.. (10.22까지)
다온비에스 다온비에스
내 소중한 세포를 위해 안심하고 맡길 수 있는 WOLF Cell Sorter를 경험하세요! (12.31까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
무료 샘플로 명품 NEB의 DNA/RNA Purifucation 성능을 경험하세요. / NEBulider®.. (9.29까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
[에펜도르프코리아] Eppendorf 2020 하반기 프로모션 행사 : 실험실 필수품 피펫,원심분리기,PCR.. (12.31까지)
인성크로마텍 인성크로마텍
Phenotype MicroArray™ - Live Cell 에너지 대사 & 감수성 프로파일링 (10.31까지)
브래디 브래디
[브래디] 초저온라벨 등 실험실용 라벨링 솔루션 (COVID19 안전사인 등) (10.30까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
TECAN 한국대리점 20주년 기념 Microplate Reader & Washer 할인이 쏟아진다! (12.31까지)
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
3/6  좌우
555,000
309,000
924,000
388,500116,600
79,50075,600
143,800136,700
158,40047,600
245,20073,600
22,7006,900
201,30060,400
136,000129,200
887,200266,200
739,000702,100
50,00015,000
246,60074,000
136,000
793,400238,100
139,000132,100
238,70071,700
80,40024,200
242,40072,800
379,000
47,20044,900
230,000
최근등록   더보기 >
천연페니실린 합성 실험 가설   09.28
매실에서 amygdalin 추출   09.28
플라스미드를 진핵세포에 삽입할 때의 의문점   09.28
human cell total rna gel electrophoresis 결과 band 좀...   09.28
물의 전기분해에 대해 질문합니다.   09.27
전자 전달계로 사용하는 Pdx/Pdr에 관해서 질문이요ㅠㅠㅠㅠ   09.27
백금과 소금으로 물을 소독할 수 있는지요?   09.27
autophagy null cell을 특별히 사용하는 목적이 있나요?   09.27
RNA복제랑 DNA복제 비교   09.27
어떤 실험을 사용해야 할까요   09.27
(주)비아이코퍼레이션
실험관련연재
박은총 연재중후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
Mr.S 연재중의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재중실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
이제욱 연재중생명과학자 기초체력 다지기
이제욱 (오송첨단의료산업진흥재단, 신약개발지원센터)
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아 광고