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질문 qPCR metling curve 질문드립니다
알밍맹뭉(대학원생)  |  01.10 00:29
첨부파일 파일첨부: 제목 없음.png (16 KB)
이미지 첨부파일

qPCR 멜팅 커브 그래프가 저렇게 나왔습니다 
픽은 77로 다른 프라이머들에 비해 빨리 멜팅 되었구요... 
딱히 다른 프라이머들보다 길이가 짧다거나 GC 값이 높다거나 이런 특이성은 없었습니다.. ㅠㅠ 

두 가지 의문점이 남습니다...

1. 비슷한 프라이머들에 비해 77도에서 빨리 멜팅된 이유는 뭐가 있을까요? 
2. 멜팅이 빨리 되었다고 해도 그래프가 깔끔하면 좋은데 픽을 찍고 그 뒤도로 작게 한번 더 굴곡이 생긴 건 어떤걸 의미하는건가요?

 

발그림 죄송합니다 ㅠㅡㅜ

#qPCR
 
#Primer
 
#melting curve
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
꽃개구리느림보  |  01.10 12:01  

Tm이 77도라면 primer-dimer 피크일 듯 합니다만, PCR 증폭물이 이차구조를 형성하는 경우도 배제할 수 없습니다. qPCR의 여러 측면을 Melting 분석만으로 다 해석하기가 어렵습니다. 간단히 2-3% 정도의 아가로즈 젤에 걸어 보면 답이 나올 것 같네요. 

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