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unclutured는 말 그대로 배양이 되지 않은 어떤 세균의 16S rRNA 염기서열입니다.
세균은 학인되는데 (또는 확인이 안되어도) 배양이 안되면 PCR로 16S rRNA를 증폭해서 sequencing을 합니다. 그때 확인된 sequence 라는 의미이며 님의 균주의 16S rRNA 염기서열과 일치했다는 의미이지 오염된 것은 아닙니다.
metagenome 할때 저런 배양되지는 않지만 PCR 증폭되는 염기서열이 많습니다.
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레벨6
Applied_Microbe
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19.12.12 13:44
저 Uncltured/environmental sample sequence 에 체크하고 진행하시면 보기 편하실거 같네요
https://www.ezbiocloud.net/
에서 16S-based ID 도 해보시고
BLAST와 비교해보시는 것도 좋을 것 같습니다.