[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
실험 테크니션 설문결과
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Microbiology > Fungi
조회 4339  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 곰팡이 genomic DNA 추출
알woo1582(대학원생)  | 2019.12.10 21:13
첨부파일 파일첨부: Fungi DNA extraction.pptx (941 KB)

안녕하세요. 미생물을 전공하고 있는 학생입니다.

이번에 곰팡이는 처음으로 gDNA를 추출하려고 하는데 잘 되지 않아서요.

Aspergillus sp. 이고 Phenol extraction, BioFact gDNA extraction kit, MP soil extraction 등 여러가지 시도를 해봤는데 잘 추출이 안되어서요...

궁금한점 몇가지 적어봅니다.

1. Nanodrop으로 측정했을 때랑 Qubit Fluorometer로 측정하였을 때 차이가 너무 심해서 왜그런거인지요? 그리고 겔에 밴드가 보이지 않는 것은 없는 것이라 생각해야겠죠?

2. 처음에 cell을 harvest할 때 어느 정도 키우고 어떤 방식으로 회수해야 할까요? (ex, 5~6일 정도 키운 포자를 filter paper에 걸러 동결건조 이런식으로)

3. 저희 실험실에서는 액체질소를 사용하지 않아 동결건조 후 막대사발로 으깨고 했는데 이 자체로는 문제가 없나요?

4. 10번 슬라이드(첨부파일 참고)에서 보듯 전기영동 결과가 위와 같은데 100bp 이하에 있는 것은 shearing된 DNA인가요?? 만약 그렇다면 이 상태로는 sequencing 진행이 불가한 것이지요?

5. 추천해주실만한 prtocol이나 kit 등이 있으면 말씀해주세요.

#gDNA
 
#fungi
 
#agarose gel
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2019.12.10   

PPT를 보니 많지는 않지만 약하게 추출은 되는것 같습니다.

현재 추출하는 protocol이 어떻게 되나요?

저분자에 나온 band는 RNA입니다.

답변하기
할인행사 광고 검색광고
바이오디 바이오디
Wet 방식의 장점에 속도와 편리함까지 지닌 eBlot & eStain 파격 할인 (8.31까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
TECAN 한국대리점 20주년 기념 할인 행사 (12.31까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
nanoString & COVID-19 / 다양한 Cloning application에 적용 가능한 com... (8.27까지)
케이비티 케이비티
[KBT] Thermo Shaker, Sonicator, Mixer, Heating Block, Rotato.. (8.16까지)
브래디 브래디
초저온라벨 등 실험실용 풀칼라프린터 (COVID-19 안전사인 지원) (8.30까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[TECAN] Reading과 형광 Imaging을 하나의 장비로 한 번에!! [Multi-mode micr.. (8.31까지)
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
4/6  좌우
493,000
139,000132,100
773,000734,400
125,500119,300
79,50075,600
109,000
92,30087,700
6,000
136,000129,200
468,000
93,20088,600
482,000
739,000702,100
17,000
370,000
482,000
52,60050,000
339,400322,500
143,800136,700
23,000
66,50063,200
130,500124,000
47,20044,900
49,000
최근등록   더보기 >
연구 가치   08.09
dim=c()이 의미하는게 뭔가요? (R studio)   08.09
cytokine ELISA 샘플 희석을 FBS가 들어있는 배지로 하면 문제가 있나요??   08.08
6X DNA dye 10ml 만들기   08.08
overnight culture의 OD 측정   08.08
plasmid DNA mini prep 질문 있습니다   08.08
마우스 보정 후 안구 이상   08.07
Raw cell이 well에 잘 안붙는것 같아요   08.07
Bacillus 속에서 flagellin을 분리할때 dialysis membrane을 어떤...   08.07
크로마토그래피가 너무 어려워요   08.07
생화학분자생물학회
실험관련연재
박은총 연재중후배에게 주고 싶은 면역학 노트
박은총(Duke University)
신코 연재중분석장비 이야기
분석장비 탐험가 (필명) ((주)신코)
Mr.S 연재중의학계의 Spectaculum: 임상시험
Mr. S (필명) (연세대학교)
에스프리 연재중실험을 해봅시다
에스프리 (필명)
곽민준 연재중랩노트
곽민준 (POSTECH 생명과학과)
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크