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histone
(비회원)
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19.12.10 14:59
primer dimer 확인해보심이 좋을듯하네요.......
지금 그래프가 프라이머 1종류의 그래프인가요?
네 한종류의 primer입니다 ㅠㅠ
dimer 확인은 따로 하는 방법이 있나요!?
사실 그냥 돌리는 방법만 알아서요 ㅠㅠ
픽은 하나네요
dimer 는 아니고 다른 사이즈의 밴드가 있습니다
젤을 걸어보면 dimer 인지 다른 사이즈 밴드가 증폭되었는지 알수 있습니다
젤에 걸어 봐야 판단이 되겠지만, 통상적인 길이의 프라이머라면 primer dimer의 피크는 80도 이하에 나옵니다.
프라이머의 specificity에 문제가 없다면, genomic DNA 오염(인트론을 낀 증폭)이거나 alternative splicing form 발현이거나 할 듯 합니다. 그런데 중간에 어떤 샘플은 양쪽 피크에 다 걸쳐져 있네요.
genome browser에서 gene 모델을 보면, genomic인지 alternative form인지가 판단할 수 있을 겁니다.