[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
연재지정자유공모모집
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > etc.
조회 3937  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 벡터 읽는방법ㅠㅠ
알우앙(대학원생)  | 2019.11.29 16:54

upload_image

 

145571_map

 

안녕하세요 고수님들 

초보대학원생입니다. CaMV 35S promotor NOS promotor 사이의 시퀀스를 이용해 프라이머제작을 하려고하는데요. 

CaMV promotor 와 NOS promotor의 방향성이 달라 헷갈립니다.

제가 생각한 것은 CaMV promotor의 3' 부터 NOS promotor 시퀀스까지의 시퀀스를 이용하여 프라이머를 제작하는것인데요. 

이게맞는지도 확신이들지않습니다. 고수님들의 의견이 필요합니다ㅠ..부탁드립니다!....

 

#벡터
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2019.11.29   

방향성하고는 상관없으며 PCR 증폭을 어디에서 어디까지하느냐에 따라

F/R primer를 디자인하면 됩니다.

원하는 부위가 어디에서 어디까지입니까?

우앙  |  2019.11.29    

upload_image

파란색으로 표기된 부분인, CaMV 35S 프로모터와 NOS 프로모터 사이의 시퀀스를 이용해서 프라이머를 제작하고 싶습니다!... 

꽃개구리느림보  |  2019.12.01   

Addgene 에서 View All Sequences 누르면 여러 서열자료가 나오는데전체 서열이 들어있는 파일을 하나 선택해서 눌러보면 등록된 유전자 정보가 기록된 서열 페이지가 열립니다제시하신 pHAtC 플라스미드를 보면

upload_image

 

이런 식으로 나오게 되는데, 여기서 프라이머를 있습니다. 뒷쪽의 CaMV 35S promoter 상위부분도 화면을 스크롤해서 내리고 작업하세요. 프라이머짜는 거니까 gRNA scaffold 쪽은  5'-AAAAAAGCACCGACTCGGTG 들어가도록 하고, 앞쪽에 적당한 클로닝용의 부가서열을 추가하고, 뒤쪽의 프라이머는 AtU6-26 프로모터의 시작서열에 맞춰서 5’-GAATGATTAGGCATCGAACC 정도로 하면 되겠네요.

*)

Addgene 안에서만 서열을 작업하기가 힘듭니다. 보통은  Genbank  포맷으로 서열을 다운받은 후에 적당한 프로그램을 써서 이런저런 작업을 하게 됩니다

*) 벡터를 제작하시는 듯 한데, 비슷하거나 똑같은 작업을 한 사람들이 이미  있습니다. 수소문해보시면 적당한 것들을 찾을 것 같네요. 

답변하기
할인행사 광고 검색광고
다온비에스 다온비에스
[DNAGenotek] Oragene Collection kit 무료샘플 사용해보세요!! (7.31까지)
다온비에스 다온비에스
[DNAGenotek] Omnigene·GUT Collection Kit 무료샘플 사용해보세요!! (7.31까지)
브래디 브래디
초저온라벨 등 실험실용 풀칼라프린터 (COVID-19 안전사인 지원) (8.30까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
[체험단 모집] 소모품이 필요 없는 Cell counter Celldrop! 체험단 모집합니다. (7.24까지)
마크로텍 마크로텍
마크로텍 Ezscope현미경 마이크로톰 특가판매 및 현미경대여 (9.30까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[TECAN] Reading과 형광 Imaging을 하나의 장비로 한 번에!! [Multi-mode micr.. (8.31까지)
케이비티 케이비티
Mixer, Dry Bath, Heating Block, Thermo Shaker, Shaking Incub.. (7.10까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
COVID-19 진단 및 연구! TECAN과 함께하세요!! (9.30까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
[에펜도르프코리아] Eppendorf 2020 상반기 프로모션 안내 : 실험실 필수품 피펫,원심분리기,PCR.. (8.8까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
3/6  좌우
370,000
66,50063,200
493,000
109,000
125,500119,300
339,400322,500
52,60050,000
136,000129,200
79,50075,600
92,30087,700
17,000
739,000702,100
482,000
482,000
23,000
47,20044,900
924,000
468,000
93,20088,600
139,000132,100
870,000
49,000
773,000734,400
6,000
최근등록   더보기 >
RNA isolation 실험준비중 질문이 있습니다.   07.02
지노 타이핑 PCR밴드 안 나올 때.   07.02
단백질 보정 방법   07.02
Vilber lourmat사의 fusion SL 사용하시는 분 계신가요?   07.02
agar와 broth의 차이   07.02
plasmidDNA 형광   07.02
배지 파우더 농도 맞게 계산했는지 확인도와주세요ㅠㅠ   07.02
dilution   07.02
장내미생물에 처음 관심갖는 사람에 대한 조언 부탁드립니다.   07.02
raw 264.7 trypsin-EDTA 사용관련   07.02
IDT Korea
제품평가
[비아이코퍼레이션]
e브릭몰(연구용 제품 온라인 구매 사이트)
비아이코퍼레이션
모집인원: 50명
모집기간: ~7/15까지
신청조건: BRIC 회원
평가자 혜택

- 참가자 전원 3만원 상품권 제공

제품평가자 모집중
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크