실험 Q&A Microbiology > Bacteria
두 균주 간의 DNA 비교 방법이 궁금합니다.
레벨4 ghtlr21 (대학생)
선배님들 안녕하세요~!
미생물을 공부하고 있는 학부 연구생입니다.
제가 질문드리고자 하는 것은 두 균주(A),(B)의 DNA를 서로 비교하고자 합니다.
원하는 결과는 NCBI에 있는 genome의 염기 수준의 차이까지 확인하고 싶은데, (무료로 배포되는) 여러 프로그램들을 사용해보아도 많이 미숙하여 진행이 어려운 상황입니다.
위 실험을 진행하고자 하는 이유는 균주 (A),(B) 사이 유사성, 동일한 단백질을 생산하는지 등 최대한 비슷한 점을 찾고자 하여 생각한 방법입니다.
굳이 위와 같은 실험이 아니라도 다른 방법이 있다면 알려주셨으면 합니다.
연구계획서를 쓰는 단계이기 때문에 여러 선택지를 알려주신다면 감사하겠습니다.
"알려진 protein sequence를 하나하나 전부 BLAST 돌려보자!" 라고 생각할 정도로 무식하기 때문에 쉬운 설명 부탁드립니다.
감사합니다.
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