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 전체 > Molecular Biology-RNA > etc.
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질문 RNA와 비타민b12가 너무 강하게 결합한거 같습니다.
알몽씨(대학생)  |  2019.09.18 16:50

RNA aptamer관련 내용입니다.

 

random sequence를 가진 RNA pool(전체 길이:116nt, 양끝은 고정서열 가운데 30서열이 random입니다.)에서 압타머 선별과정을 통해 비타민 B12와 결합하는 RNA압타머를 선별하려고 합니다.

 

비타민B12와 결합한 RNA 압타머의 서열을 알기위해 RT-PCR을 진행했는데

밴드상 길이가 가운데 랜덤 서열이 짤리고 양끝 고정서열(프라이머가 붙은 서열)만 존재했습니다. 

 

추즉 상 RNA와 비타민이 너무 강하게 결합해서 RT 혹은 PCR과정에서 DNA중합효소가 작용하지 않았나 싶습니다.

 

질문: RNA와 비타민B12의 결합력을 약하게 안다음에 RT-PCR을 진행해보려 합니다. 결합력을 약하게 하는 방법이 있을까요? 

#APTAMER
 
#RNA
 
#압타머
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2019.09.18   

VB12와 결합하는 aptamer만 1차 선별한 후 실험을 진행 것인가요?

자세한 사항은 모르겠지만 질문 내용만 보면 B12가 결합되어 있는 것은

아닐것 같습니다.

aptamer-VB12구조가 맞는지 화학적으로 확인은 해 봤나요?

제가 보기에는 짧은 RNA의 RT-PCR 조건에 문제가 있는건 아닌지 검토해

보는것이 좋지 않을까 합니다.

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