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 전체 > Molecular Biology-RNA > Purification/Isolation
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질문 마우스 뼈조직에서 RNA 추출
알SSacred(대학원생)  |  2019.08.22 18:12

안녕하세요.

 

마우스 대퇴골에서 RNA를 추출하려고 합니다.

보통 프로토콜 상에는 Trizol과 액체질소를 사용해서 RNA를 추출하는 게 많던데 저희 랩실에는 NucleoZOL 제품이 있습니다.

NucleoZOL은 Phenol이 없고 Trizol은 Phenol이 있는 차이로 알고는 있는데 현재 사용중인 Nucleozol 제조사 홈페이지에 기록된 예시 조직 샘플에는 Bone이 적혀있지 않아서요.

혹시 뼈 조직에서 RNA를 추출할 때 Trizol을 사용하는 특별한 이유가 있을까요? 그리고 Nucleozol은 뼈조직에서 RNA 뽑아낼 때 사용하면 안되는건가요?

 

고수님들의 답변 부탁드립니다. 감사합니다.

#Nucleozol
 
#Trizol
 
#RNA
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리SPEED  |  2019.08.22   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

Trizol의 2 phase 방식을 1 phase 방식으로 바꾼 제품이 Nucleozol입니다.

전처리만 잘하면 2개 시약 모두 RNA 분리가 잘됩니다.

Bone으로 부터의 RNA 수율 및 quality에 가장 중요한 것은 전처리 과정입니다.

개구리A'ANE  |  2019.08.23   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

보통 뼈에서 RNA추출 시 중요한 부분은 전처리과정입니다.

 

샘플을 파쇄하여 조직 RNA를 뽑을 수 있는 상태로 만드는 것인데

 

많이 사용하는것은 Beadbeater를 이용한 Homogenizing입니다

(예시, http://www.kyongshin.com/productview.php?pd_id=14)

뼈라는게 굉장히 딱딱한 샘플이기 때문에 기기의 파쇄력에 따라서 시간/온도/RPM이 차이가 나게 되고 최대한 발열이적고 RPM이 센 제품을 사용해서 파쇄를 진행하게 됩니다. 파워가 부족한 장비의 경우 시간이오래걸리고 발열이 심하여 RNA손상이 일어날 수 있습니다.

 

이렇게 물리적으로 잘 파쇄된 상태의 샘플이라면 역시 샘플마다의 차이는 있지만 어떤 RNA추출 방식을 사용한다고해도 일정량의 RNA를 잘 얻으실 수 있습니다. Trizol의 경우 Lysis가 잘 되서 Beadbeater에 Bead tube+ Trizol + 샘플 넣고 돌려서 뽑는 경우가 많지요

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