[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
제품평가단 모집
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
LABox-과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 1954  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 DNA sequencing 해석하는데 질문이 있습니다.
알jy888(과기인)  |  2019.08.21 11:28

이번에처음 DNA sequencing한 결과물이 도착했습니다.  Chromas로 해석하려는데 양끝 서열이 해석되지 않아서 찾아본 결과 양끝 서열의 일부는 그냥 무시하라는 답변만 받았습니다. 고수님들 DNA sequencing 에서 양끝 서열이 해석되지 않는 이유를 알려주시면 정말 고맙겠습니다. 

그리고upload_image

사진의 서열위의 네모칸이 무엇을 뜻하는지 알려주시면 정말 감사하겠습니다.

네모칸의 색깔이 비어있는것과 약간 채워져있는것 전부 채워져있는 것의 차이가 무엇인지도 알고싶습니다.

#sequencing
 
#시퀀싱
 
#해석
답변하기
검색광고 검색광고
[에펜도르프코리아] NGS 라이브러리 전처리를 간편하게 Eppendorf epMotion자동분주기
자동 Next Generation Sequencing 라이브러리 준비는 피펫팅 오류를 최소화해 재현 가능한 결과를 보장하고 생산성을 향상시킵니다.제품문의 T)1577-4395
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리안재진  |  2019.08.21   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

시퀀싱에서 앞쪽과 뒷쪽이 못 읽는것보다는 정확도가 떨어지는 부분입니다.
pick overlay가 생겨 정확하게 믿을수가 없어 양쪽 끝단은 포기하는 부분입니다.

그 부분이 중요하다면 더 앞쪽이나 뒷쪽에서부터 읽어 와야할 것입니다. 또 중첩해서 읽는것도 하나의 방법이구요...

시퀀싱 의뢰 업체에 연락하시면 게런티 할수 있는 지역이 어디인지 확인을 해줄것입니다.

저 네모칸은 아마다 각 시퀀스의 픽의 형광도를 나타낸것 같네요... 보통 선형 그래프로 주는데 저 업체는 박스형태로 주네요...

관련해서는 시퀀싱 업체에 문의하시면 상세히 설명해줄것 같습니다.

Hi  |  2019.08.21    
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

DNA sequencing 분석에 ABI 3730XL 장비를 사용하고 있습니다. ABI 3730XL  capillary array lenghts 에 따라 다르기는 하나 분석회사에서는 보통 700bp ~ 900bp를 보장해주고 있습니다. sequencing 분석시 사용되는 primer가 DNA(plasmid or PCR product)에 binding 한 후 이어서 순서대로 염기서열을 분석하게 되는데 primer binding 되는 부분에서 ~50/60bp 정도가 peak이 정확하지 않습니다.  1kb 넘는 염기서열 분석 data를 받았어도 보장되는 정확도는 ~900bp 입니다. 뒷 부분은 peak이 정확하지 않습니다. 

네모칸은 분석 peak의 정확도 입니다. 상자의 색이 다 채워지면 정확도가 높습니다. 

답변하기
할인행사 광고 검색광고
케이비티 케이비티
Stirrer, Dry Bath, Shaking Incubator, Thermo Shaker 등 다양한 제품.. (6.31까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
Eppendorf 2020 상반기 프로모션 안내 : 실험실 필수품 피펫,원심분리기,PCR장비,초저온냉동고,M.. (4.1까지)
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
2/6  좌우
87,40083,100
86,90082,600
20,40019,400
69,20065,800
317,100301,300
74,50070,800
47,20044,900
111,300105,800
80,00076,000
50,40047,900
195,700186,000
67,10063,800
55,70053,000
66,50063,200
62,00058,900
52,70050,100
84,70080,500
59,30056,400
39,70037,800
169,600161,200
196,000186,200
12,00011,400
153,100145,500
154,700147,000
최근등록   더보기 >
bacteriophage contamination 의심되는데 확인 방법이 있을까요   03.30
인도메타신 유발 위염 동물모델 질문이에요ㅠㅠ   03.30
sealing material   03.30
Lysis buffer를 필터링 해도 문제가 없을까요?   03.30
SH MDAMB231의 cell line이 뭔가요?   03.30
RINm5F cell 분양해 주실분 계신가요?? 부탁드립니다ㅠㅠ   03.30
FACS cell cycle analysis program을 찾고있습니다.   03.29
센트럴 도그마 질문이요   03.29
deep freezer에 보관하는 bacteria stock을 상온에 하루동안 방치했으면...   03.29
cell 곰팡이 오염 제발 도와주세요ㅠㅠ..   03.29
라이카코리아
제품평가
[필코리아테크놀로지]
Sapphire Biomolecular Imager
필코리아테크놀로지
모집인원: 10명
모집기간: ~3/31까지
신청조건: BRIC 회원
평가자 혜택

- 참가자 전원 10만원 상품권 제공
- 우수평가자 5명에게 10만원 상품권 추가 제공

제품평가자 모집중
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아