[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
설문조사
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 988  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 DNA sequencing 해석하는데 질문이 있습니다.
알jy888(과기인)  |  08.21 11:28

이번에처음 DNA sequencing한 결과물이 도착했습니다.  Chromas로 해석하려는데 양끝 서열이 해석되지 않아서 찾아본 결과 양끝 서열의 일부는 그냥 무시하라는 답변만 받았습니다. 고수님들 DNA sequencing 에서 양끝 서열이 해석되지 않는 이유를 알려주시면 정말 고맙겠습니다. 

그리고upload_image

사진의 서열위의 네모칸이 무엇을 뜻하는지 알려주시면 정말 감사하겠습니다.

네모칸의 색깔이 비어있는것과 약간 채워져있는것 전부 채워져있는 것의 차이가 무엇인지도 알고싶습니다.

#sequencing
 
#시퀀싱
 
#해석
답변하기
검색광고 검색광고
[(주)필코리아테크놀로지] NEB 사의 NGS Library Prep kit을 만나보세요. (주)필코리아테크놀로지 국내총판
Low Input Amount, Simple Worflow, High Library Yield를 자랑하는 NEB사의 NGS 제품으로 직접 NGS library를 제작하세요. 주문 02-2105-7020, 042-862-9636, info@philekorea.co.kr
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

시퀀싱에서 앞쪽과 뒷쪽이 못 읽는것보다는 정확도가 떨어지는 부분입니다.
pick overlay가 생겨 정확하게 믿을수가 없어 양쪽 끝단은 포기하는 부분입니다.

그 부분이 중요하다면 더 앞쪽이나 뒷쪽에서부터 읽어 와야할 것입니다. 또 중첩해서 읽는것도 하나의 방법이구요...

시퀀싱 의뢰 업체에 연락하시면 게런티 할수 있는 지역이 어디인지 확인을 해줄것입니다.

저 네모칸은 아마다 각 시퀀스의 픽의 형광도를 나타낸것 같네요... 보통 선형 그래프로 주는데 저 업체는 박스형태로 주네요...

관련해서는 시퀀싱 업체에 문의하시면 상세히 설명해줄것 같습니다.

금개구리안재진  |  08.21 16:29  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

DNA sequencing 분석에 ABI 3730XL 장비를 사용하고 있습니다. ABI 3730XL  capillary array lenghts 에 따라 다르기는 하나 분석회사에서는 보통 700bp ~ 900bp를 보장해주고 있습니다. sequencing 분석시 사용되는 primer가 DNA(plasmid or PCR product)에 binding 한 후 이어서 순서대로 염기서열을 분석하게 되는데 primer binding 되는 부분에서 ~50/60bp 정도가 peak이 정확하지 않습니다.  1kb 넘는 염기서열 분석 data를 받았어도 보장되는 정확도는 ~900bp 입니다. 뒷 부분은 peak이 정확하지 않습니다. 

네모칸은 분석 peak의 정확도 입니다. 상자의 색이 다 채워지면 정확도가 높습니다. 

Hi  |  08.21 17:45   
답변하기
할인행사 광고 검색광고
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[Tecan] 우수한 흡광전용 Microplate Reader 를 저렴하게 구매 할 수 있는 기회! (1.7까지)
라이카코리아 라이카코리아
[보상판매 이벤트] 현미경 사용 중이신가요? Leica 현미경을 35% 할인해드립니다! (1.4까지)
바이오클론 바이오클론
(1+1증정) WB, IHC-P 하신다면!? Primary ab 구매시 secondary ab 무료로 드립니.. (12.27까지)
정코퍼레이션 정코퍼레이션
초저온 -196도 라벨 / 냉동용 라벨 / 자일렌용 라벨 / 슬라이드라벨 /바코드인쇄 / 라벨프린터 (12.31까지)
코람바이오텍 코람바이오텍
[Cell Signaling Technology] 할인 이벤트 (11.26까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
5/6  좌우
38,10036,000
234,600223,000
36,30034,000
118,900113,000
218,200207,000
78,00074,000
231,000219,000
76,60073,000
45,60043,000
245,100233,000
56,30053,000
56,90054,000
75,50072,000
121,700116,000
100,30095,000
172,100163,000
36,30034,000
130,00065,000
49,70047,000
286,700272,000
82,80079,000
123,500117,000
97,20092,000
668,600334,000
최근등록   더보기 >
유세포 분석 발현이 99.5정도 나온다는게 맞나요?   11.15
유세포 분석 발현이 99.5정도 나온다는게 맞나요?   11.15
유세포 분석 발현이 99.5정도 나온다는게 맞나요?   11.15
Branch-chain amino acid kit 사용에 관해서 질문드립니다.   11.15
western blot 실험시, 항체 반응 후 ponceau S staining   11.15
scale bar넣는 방법   11.15
함수율 측정기 사용법에 대해 조언 부탁드립니다.   11.15
미생물 계통 tree   11.15
probe qPCR 그래프 질문   11.15
시간이 지날수록 debris가 많이 관찰이 되는 media   11.15
한국기초과학지원연구원
투표진행
Q. 내가 생물학 연구를 목표로 미래를 설계한 시기는?
참여하기
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크