[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
웨비나모집
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 911  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 DNA sequencing 해석하는데 질문이 있습니다.
알jy888(과기인)  |  08.21 11:28

이번에처음 DNA sequencing한 결과물이 도착했습니다.  Chromas로 해석하려는데 양끝 서열이 해석되지 않아서 찾아본 결과 양끝 서열의 일부는 그냥 무시하라는 답변만 받았습니다. 고수님들 DNA sequencing 에서 양끝 서열이 해석되지 않는 이유를 알려주시면 정말 고맙겠습니다. 

그리고upload_image

사진의 서열위의 네모칸이 무엇을 뜻하는지 알려주시면 정말 감사하겠습니다.

네모칸의 색깔이 비어있는것과 약간 채워져있는것 전부 채워져있는 것의 차이가 무엇인지도 알고싶습니다.

#sequencing
 
#시퀀싱
 
#해석
답변하기
검색광고 검색광고
[(주)필코리아테크놀로지] NEB 사의 NGS Library Prep kit을 만나보세요. (주)필코리아테크놀로지 국내총판
Low Input Amount, Simple Worflow, High Library Yield를 자랑하는 NEB사의 NGS 제품으로 직접 NGS library를 제작하세요. 주문 02-2105-7020, 042-862-9636, info@philekorea.co.kr
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

시퀀싱에서 앞쪽과 뒷쪽이 못 읽는것보다는 정확도가 떨어지는 부분입니다.
pick overlay가 생겨 정확하게 믿을수가 없어 양쪽 끝단은 포기하는 부분입니다.

그 부분이 중요하다면 더 앞쪽이나 뒷쪽에서부터 읽어 와야할 것입니다. 또 중첩해서 읽는것도 하나의 방법이구요...

시퀀싱 의뢰 업체에 연락하시면 게런티 할수 있는 지역이 어디인지 확인을 해줄것입니다.

저 네모칸은 아마다 각 시퀀스의 픽의 형광도를 나타낸것 같네요... 보통 선형 그래프로 주는데 저 업체는 박스형태로 주네요...

관련해서는 시퀀싱 업체에 문의하시면 상세히 설명해줄것 같습니다.

금개구리안재진  |  08.21 16:29  
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

DNA sequencing 분석에 ABI 3730XL 장비를 사용하고 있습니다. ABI 3730XL  capillary array lenghts 에 따라 다르기는 하나 분석회사에서는 보통 700bp ~ 900bp를 보장해주고 있습니다. sequencing 분석시 사용되는 primer가 DNA(plasmid or PCR product)에 binding 한 후 이어서 순서대로 염기서열을 분석하게 되는데 primer binding 되는 부분에서 ~50/60bp 정도가 peak이 정확하지 않습니다.  1kb 넘는 염기서열 분석 data를 받았어도 보장되는 정확도는 ~900bp 입니다. 뒷 부분은 peak이 정확하지 않습니다. 

네모칸은 분석 peak의 정확도 입니다. 상자의 색이 다 채워지면 정확도가 높습니다. 

Hi  |  08.21 17:45   
답변하기
할인행사 광고 검색광고
코람바이오텍 코람바이오텍
[Proteintech] Antibodies against 12,000 targets 외 전품목 할인 행사.. (12.9까지)
마크로텍 마크로텍
Ezscope Nikon 현미경 마이크로톰 특가판매 (12.30까지)
엠피바이오메디칼스코리아 엠피바이오메디칼스코리아
샘플파쇄 단 40초! 비드호모게나이저 특별할인행사: 가격할인+사은품 증정 (12.31까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
6/6  좌우
130,00065,000
286,700
286,700
144,900138,000
286,700
137,600131,000
50,50048,000
286,700
107,200102,000
180,700172,000
668,600334,000
231,000219,000
121,700
82,800
56,70054,000
286,700
286,700
231,000219,000
218,200
113,500108,000
79,80076,000
49,700
101,90097,000
123,900118,000
최근등록   더보기 >
dna는 끈적거리고 rna는 왜 끈적이지 않은지 궁금합니다   10.19
geneall plasmid kit 쓰시는 분 계신가요?   10.19
액체배지 배양할때 cell뭉침 현상은 왜그런건가요?   10.19
TCA DOWN에서 sample bufffer넣고 끓이는 이유가 궁금해요   10.19
TLC 전개용매 검액 비율 도와주세요ㅠㅠ   10.19
immunogold labeling 관련 질문입니다.   10.19
sds page만들면서 궁금한 점 질문 드리겠습니다!   10.19
대장균 배양된 액체배지를 구매하려 하는데   10.19
RNA 추출 시료 관련 질문입니다   10.18
단백질 보정에 대한 질문입니다.   10.18
광주과학기술원 의생명공학과
투표진행
Q. Protease 혹은 Phosphatase inhibitor를 넣으시나요? 웨스턴을 진행한다 가정을 하고 샘플은 셀에서 RIPA로 lysis를 진행한다할때 여러분께서는 inhibitor를 넣으시나요?
참여하기
Q. 영문교정 맘에드는곳(?) 은 어디였나요
참여하기
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아