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CRISPR로 제작한 cell line의 off-target effect 혹은 multiple mutation을 확인하는 방법?
레벨1 mjh (과기인)
실험에서 특정 유전자를 CRISPR로 날린 KO 세포주를 가지고 실험을 하였고,
논문 리비전 코멘트에 저희가 확인한 약제를 쳤을 때의 phenotype이 multiple mutation에 의한 것이 아닌지 어떻게 장담하냐는 얘기가 있었습니다.
실제로는 control과 약제를 친 실험군 모두 KO세포주에서 실험을 했기 때문에, cell line문제로 인한 phenotype으로 보기는 어렵습니다만,
어쨌든 리뷰어가 지적해서 최대한 답을 하고자 합니다만, 좋은 아이디어가 떠오르지 않아 여쭙습니다.
Whole exome sequencing을 하는 것은 좀 아닌 것 같고, 분석할 역량도 없는데, multiple mutation이나 off-target effect가 없음을 확인할만한 좋은 방법이 있을까요?
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