[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
웨비나모집
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
조회 326  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 PCR primer dimer 형성 관련 질문드립니다.
올챙이야생의잉어킹(대학원생)  |  06.28 15:33

안녕하세요! PCR 결과 관련해서 질문 드립니다.

 

miRNA RT-qPCR을 하고 나서 gel을 내려보는데,

지속적으로 target gene band 대신 더 짧은 위치에서 엑스트라 밴드를 얻고 있습니다. target gene band는 100 mer 정도 위치에서 나오는데 이 band는 50 mer 근방에서 뜨고 있어요.

qPCR Ct 값이 높은 샘플일수록 점점 50 mer 밴드가 진해지는 것으로 보아 아마 primer dimer인 것으로 추정이 됩니다.

 

원인을 찾던 중 positive control은 항상 흔들리지 않는 것으로 봐서 일단 template 내 target gene 농도가 낮은 것이 원인으로 생각이 되는데, template에 PCR inhibitor가 포함이 되어 있을 가능성이 생겼습니다. 어떤 종류의 inhibitor인지는 확실하진 않습니다.

그런데 template에 inhibitor가 들어있을 때 이렇게 primer dimer가 증폭이 되기도 하나요...? 찾아보니 primer dimer에 의해 컨탬되었을 때 그럴 수 있다고만 뜨는데, 일반적으로 inhibitor에 의한 컨탬이 있을 때에도 비슷한 일이 벌어질 수 있는지 궁금합니다.

혹은 모종의 이유로 RNA가 degradation이 된 것인지...

 

경험해보신 분들의 의견 기다립니다. 감사합니다.

#RT-qPCR
 
#전기영동
 
#PCR inhibitor
답변하기
검색광고 검색광고
[(주)필코리아테크놀로지] (주)필코리아 Agarose, Size Marker, Loading dye 최고의 가성비!! 견적받아보세요!
PCR 후 전기영동에 가장 많이 사용하는 소모품 agarose, size marker, loading dye 를 저렴하게 양질의 제품으로 만나보세요. PK Brand 에서 확인하실 수 있습니다. 주문 02-2105-7020, 042-862-9636, info@philekorea.co.kr
첫 댓글을 달아주세요.첫 답변을 달아주세요.
답변하기
할인행사 광고 검색광고
코람바이오텍 코람바이오텍
[Proteintech] 전품목 할인 행사 !!! (12.9까지)
마크로텍 마크로텍
Ezscope Nikon 현미경 마이크로톰 특가판매 (12.30까지)
엠피바이오메디칼스코리아 엠피바이오메디칼스코리아
샘플파쇄 단 40초! 비드호모게나이저 특별할인행사: 가격할인+사은품 증정 (12.31까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
5/6  좌우
286,700
144,900138,000
107,200102,000
101,90097,000
137,600131,000
56,70054,000
286,700
123,900118,000
286,700
286,700
286,700
50,50048,000
79,80076,000
130,00065,000
231,000219,000
218,200
180,700172,000
49,700
121,700
113,500108,000
82,800
231,000219,000
668,600334,000
286,700
최근등록   더보기 >
DMSO 제거   10.17
손세균 배양 결과 입니다. 분석 바랍니다.   10.17
bacterial biofilm formation, removing bacteria 시에   10.17
Phytagel이 들어간 미생물 혐기배지를 만들었는데 굳지도 않고 색도 이상해요ㅠㅠ   10.17
gDNA 추출시 질문있습니다!   10.17
ELISA 결과분석   10.17
cell cytoplasm 에 발생한 기포 like substance   10.17
Co-IP 프로토콜 및 설명입니다.   10.17
케톤산증과 TCA회로의 연관에 대해 설명해주세요   10.17
천연식물 에탄올 추출시   10.17
광주과학기술원 의생명공학과
투표진행
Q. Protease 혹은 Phosphatase inhibitor를 넣으시나요? 웨스턴을 진행한다 가정을 하고 샘플은 셀에서 RIPA로 lysis를 진행한다할때 여러분께서는 inhibitor를 넣으시나요?
참여하기
Q. 영문교정 맘에드는곳(?) 은 어디였나요
참여하기
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아