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질문 기존 프라이머의 사이즈를 늘리고 싶을때
알gnsmla(일반인)  |  05.28 15:52

프라이머의 갯수가 너무 많아서 기존꺼끼리 다시 짜서 프라이머 갯수는 줄이고 증폭하는 시퀀스 사이즈는 늘리고 싶습니다. 한 500bp정도로 증폭되는데800~1000bp으로 증폭되게 다시 짜고 싶어요. 제가 프라이머를 짜본적이 없어서 기존꺼를 가지고 어떻게 확인하고 짜야되는지 모르겠어요.ㅠㅠㅠㅠ  너무 기초인데 부끄럽지만 도움 부탁드립니다. primer3plus나 ncbi blast로 하는건지요...

#프라이머
 
#프라이머 제조
 
#PCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.

프라이머의 용도가 뭔지부터 생각이 필요할것 같습니다.

단백질 발현처럼 full  size의 클로닝용 프라이머가 필요하신가요?

아니면 발현정도를 확인하는 qPCR용 프라이머가 필요하신가요?

전자라면 내가 클로닝을 하려는 전체 시퀀스를 가지고 프라이머를 짜셔야 하고 발현 정도를 확인하려면 qPCR용 전체 시퀀스가 아닌 특이적인 일부 지역에 대해 프라이머를 짜시는게 유리합니다.

금개구리안재진  |  05.28 16:22  

아... 프라이머는 mtdna sequencing을 위해 만든 프라이머입니다. mtdna 모든 구간을 돌리기 위해 만들었습니다. 프로그램을 어떻게 써서 tm값이라던가 그런 조건들을 확인하고 forward revese 짝지어서 짜야될까요?

알gnsmla  |  05.28 16:53  
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