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어떤 유전자 염기서열을 사용하셨는지는 모르겠으나,
사용한 유전자에 따라서 계통수는 조금씩 다르게 표시됩니다.
그것은 유전자의 염기가 얼마나 변했는지(또는 보존되었는지)를 따지기 때문입니다. 물론, 어떤 위치의 염기는 변이가 심하고 어떤 위치의 염기는 그렇지 않을 수 있으므로 모든 염기의 변이가 모두 같은 값을 가지지는 않기 때문에 몇%의 염기 상동성이 근연관계의 가까움과 정비례하지는 않습니다.
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레벨2
ㅁㅁㅈㅈ
(과기인)
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19.05.22 10:20
16s rRNA서열들을 비교한겁니다.
그게 계통수 분석이죠.
Similarity는 변이 진화의 연속적인 과정이 아니라 양적인 지표로 생각할 수 있습니다. 계통수도 여러가지지만 기본적으로 보전된 공통변이를 묶어가는 개념이기 깨문에 양적으로 상당히 비슷한 서열도 다른 변이계통으로 나오는 경우가 있습니다.
위 그림에서는 위쪽 사지와 밑의 가지의 변이계통이 다른 것으로 해석할 수 있습니다. 염기서열 정렬파일에서 parsimony informative site 들을 찾아보면 확실히 이해되실 거예요.