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질문 Mega프로그램으로 계통수 그릴때...
알감독자를 위해(과기인)  |  05.20 14:55
첨부파일 파일첨부: 그림1.docx (619 KB)

phlyogenetic tree를 그리고 있는데 자꾸 오류(에러?)가 나서 질문드립니다.

DNA sequence(Fasta 파일)로부터 MEGA 7의 maximum liekelihood 방법으로
pylogenetic tree를 시도하고 있는데요. 도무지 해결책이 안보여서요

첨부한 파일을 봐주세요.

그림1-NCBI에서 찾은 타겟 시퀀스들을 fasta파일로 붙여놓기 한후 alignment 했습니다.

그림2-alignment 한후 그림에서 처럼 phylogeny에서 Construct/Test Maximum Likelihood Tree를 클릭한후

그림3-설정은 따로 이상하게 하지 않았구요, phylogeny에서 Construct/Test Maximum Likelihood Tree하고 나면 tree가 떠야 되는데 그림3처럼 창이 뜹니다. 

뭐가 잘못된걸까요? Mega 7 다운받고 처음 할때는 위와같은 순서대로 할 경우 tree가 잘 만들어졌었는데 갑자기 안되네요.

Mega7이 잘안되서 Mega x, Mega 6, Mega5 각각 다운받아 해봤지만

똑같은 패턴으로 tree가 만들어지지 않아요.

Mega 프로그램 잘 아시는 분들 ...왜 안되는지 설명좀 부탁드릴게요.

MEGA 프로그램 아닌 다른 사용하기쉬운 program이 있을까요?
 

#계통수
 
#Mega
 
#tree
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.

[그림1]의 alignment 완료후, "Data"를 클릭하고 "Phylogenetic Analysis"를 실행하셔야 합니다. 그래야만 지금 alignment 된 서열을 가지고 phylogenetic analysis를 하는 것으로 MEGA 프로그램이 인식하게 됩니다. 이후 [그림2]처럼 실행하시면, "“Would you like to use the currently active data (PhyloAnalysis-1.meg”?” 식의 메시지가 나옵니다. 그때 “Yes” 선택하시면 됩니다.

MEGA 보다 더 쉬운 프로그램은 저도 잘 모르겠습니다.

좋은 결과 얻으세요.

 

아웃사이더  |  05.20 22:19   
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