[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
2019 Bio Top5 인터뷰
스폰서배너광고 안내  배너1
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 799  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 Mega프로그램으로 계통수 그릴때...
알감독자를 위해(과기인)  |  2019.05.20 14:55
첨부파일 파일첨부: 그림1.docx (619 KB)

phlyogenetic tree를 그리고 있는데 자꾸 오류(에러?)가 나서 질문드립니다.

DNA sequence(Fasta 파일)로부터 MEGA 7의 maximum liekelihood 방법으로
pylogenetic tree를 시도하고 있는데요. 도무지 해결책이 안보여서요

첨부한 파일을 봐주세요.

그림1-NCBI에서 찾은 타겟 시퀀스들을 fasta파일로 붙여놓기 한후 alignment 했습니다.

그림2-alignment 한후 그림에서 처럼 phylogeny에서 Construct/Test Maximum Likelihood Tree를 클릭한후

그림3-설정은 따로 이상하게 하지 않았구요, phylogeny에서 Construct/Test Maximum Likelihood Tree하고 나면 tree가 떠야 되는데 그림3처럼 창이 뜹니다. 

뭐가 잘못된걸까요? Mega 7 다운받고 처음 할때는 위와같은 순서대로 할 경우 tree가 잘 만들어졌었는데 갑자기 안되네요.

Mega7이 잘안되서 Mega x, Mega 6, Mega5 각각 다운받아 해봤지만

똑같은 패턴으로 tree가 만들어지지 않아요.

Mega 프로그램 잘 아시는 분들 ...왜 안되는지 설명좀 부탁드릴게요.

MEGA 프로그램 아닌 다른 사용하기쉬운 program이 있을까요?
 

#계통수
 
#Mega
 
#tree
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
아웃사이더  |  2019.05.20    

[그림1]의 alignment 완료후, "Data"를 클릭하고 "Phylogenetic Analysis"를 실행하셔야 합니다. 그래야만 지금 alignment 된 서열을 가지고 phylogenetic analysis를 하는 것으로 MEGA 프로그램이 인식하게 됩니다. 이후 [그림2]처럼 실행하시면, "“Would you like to use the currently active data (PhyloAnalysis-1.meg”?” 식의 메시지가 나옵니다. 그때 “Yes” 선택하시면 됩니다.

MEGA 보다 더 쉬운 프로그램은 저도 잘 모르겠습니다.

좋은 결과 얻으세요.

 

답변하기
할인행사 광고 검색광고
코람바이오텍 코람바이오텍
[OriGene] IHC Reagents, shRNA, CRISPR, Proteins, Lentivirus.. (4.27까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
Eppendorf New 25mL Conical Tubes : 혁신적인 디자인과 다양하고 편리한 사용 (4.1까지)
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
3/6  좌우
67,10064,000
224,300213,000
69,10066,000
105,100100,000
97,50093,000
107,900103,000
144,400137,000
80,90077,000
126,700120,000
93,50089,000
50,40048,000
577,200548,000
77,30073,000
117,300111,000
254,000241,000
50,50048,000
55,70053,000
93,00088,000
36,50035,000
114,100108,000
86,90083,000
51,10049,000
103,80099,000
154,700147,000
최근등록   더보기 >
항원 구매 관련 질문드립니다.   02.27
Tryptone (Difco 0123)대체제 추천 및 트립톤구입처   02.27
Polysome Profiling data 볼 때 Y axis (254 nm) 는 무엇을...   02.27
항체 취급 관련 질문드려요(폐기)   02.27
구강세균 관찰 실험 문의드립니다.   02.27
sodium phosphate/imidazole buffer만들때 문의드립니다   02.26
덕산 DMSO를 mammalian cell cyropreservation에 사용해보신 분...   02.26
sp20 cell thawing 과정좀 확인해주세요   02.26
cell passage 관리   02.26
미생물 배양 관련 (KCTC에서 구입)   02.26
에스엘에스바이오
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
에펜도르프코리아