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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 어떤 유전자가 없는 mutant인지 알고 싶을때
알tresf1588(대학생)  |  2019.05.09 10:14

안녕하세요 저는 박사과정생인 학생입니다.

제가 어떤 mutant가 있는데 그 mutant의 sequence를 알지 못해요...

다른 사람한테 library 형태로 받은 것이고, 그 중 하나를 꺼냈는데 원래 그 자리에 있어야 할 유전자가 아니라 그에 대한 어떤 정보도 알 수가 없습니다.

그 유전자 이름도 모르는 상황일 sequence를 검색해볼수도 없어요

혹시 이런 상황에서 그 유전자가 무엇인지 알려면 어떤 실험을 해 볼 수 있을까요??ㅠㅠ

#deletion
 
#sequence
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리강시  |  2019.05.09   

어떤 식으로 만든 mutant인디에 따라서 답이 나올것도 같습니다만.....

막연히 mutant라고 하면 답이 없어요.

 

알tresf1588  |  2019.05.09   
KanMX로 그 부분을 deletion시켰어요~
대왕개구리SPEED  |  2019.05.09   

분양받은 사람한테 사용한 Kan casette의 서열을 문의해 보세요..

L/R 서열을 보면 deletion gene이 어떤것인지 어느정도 추정이 가능할 것

같습니다.

알tresf1588  |  2019.05.09   

southern blot이나 다른 실험 기법을 이용해서 모르는 유전자의 서열을 알 수 있는 방법은 없나요?

대왕개구리강시  |  2019.05.09   

서던블랏은 kanMX가 genome에 삽입된 것은 알 수 있지만 어느 유전자에 들어갔는지는 모릅니다.

보통 이 카세트를 사용할때 카세트 양옆에 타겟 유전자의 서열을 PCR로 넣어주거나 유전자 library를 만들어서 random하게 genomic insertion을 시킵니다.

만일 타겟 유전자 서열을 알 수 있다면 어느 유전자가 깨졌는지 알 수 있지만 random하게 들어간 경우라면 좀 어렵습니다.

library를 만든 사람에게 연락하는 것이 제일 확실한 방법입니다.

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