실험 Q&A Mol. Biol.-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
qRT-PCR primer 관련 질문입니다
레벨1 실험해보까 (대학원생)
안녕하세요
제가 지금 소장세포에서 RNA extraction후
qRT_PCR을 이용하여 cytokine level을 확인하고자 계획을 세운상태인데,
qRT-PCR primer를 찾던 와중에 혼란스러운 점이 있어 질문합니다
1. murine (mouse) primer는 마우스간의 계통 상관없이 통용적으로 사용가능한가요?
예를들어, 제가 준비한 샘플은 C57BL/6 마우스인데 제가 찾은 논문은 DBA/1J mouse 샘플을 이용한 qRT-PCR 결과입니다. 논문의 레퍼런스 primer set를 b6 mouse의 샘플에 사용가능한가요?
2. murine primer 중에서도 논문마다 사용한 sequence가 다른데 이런경우는 보통 어떻게 primer를 선택하는것이 좋을까요?
지금 다양한 논문을 통해서 primer 정보를 모으고있는데 sequence가 다른 primer들이 존재하여 어떤 primer set을 정하는게 좋은지 고민중이에요 ㅠㅠ
답변기다리겠습니다
감사합니다 :)
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