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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
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질문 시퀀싱 결과가 잘 안나왔는데 뭐가 문제인지 잘 모르겠습니다ㅠㅠ
알뜌뜌(과기인)  | 2019.04.29 12:30
첨부파일 파일첨부: fdsfsdf.JPG (183 KB)
이미지 첨부파일

완전 초보자입니다ㅠㅠ

pCR2.1 TOPO vector에 500bp정도의 insert DNA를 넣고

플라스미드 정제해서 시퀀싱을 맡겼습니다.

 

근데 결과가 이렇게 나왔네요ㅠㅠ 

프라이머 문제는 아닌 것 같고 template 문제 같은데 문제가 뭔지 모르겠습니다.

template 농도도 충분하게 보냈고, OD 측정했을 때도 괜찮게 나왔는데 왜 저런걸까요..

 

ligation이 잘 안돼서 저런 것일 수도 있나요?

#plasmid
 
#sequencing
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리안재진  |  2019.04.29   

시퀀싱상 DNA template의 순도에 문제가 생기면 제대로 읽히지 않습니다. 실험자는 한다고 하는데도... 이런문제가 생기면 골치아프죠.

정말 시퀀싱한 클론이 맞다고 생각하면 배지에 콜로니를 따서 보내고 시퀀싱업체에서 prep을 하게 하는것이 편해요. 프랩비용으로 몇천원 더 나오는데 감담할만한 가격입니다.

꽃개구리느림보  |  2019.04.29   
표준적인 반응조건에 맞지 않은 경우 가끔 저럴 수 있어요.
코*모 회사에서 재반응 해줍니다. 하루 더 기다려 보세요.
대충 확인해보려면 저 서열을 목적 저열과 정렬해서 대강이라도 맞는지 확인할 수 있습니다. 영 아니다 싶으면 다른 클론을 보내세요.
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