[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
랩박스 - 형광 이미징의 모든 것
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3 배너4
과학으로 본 코로나19 (COVID-19)
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 906  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 NGS사용 하지 않고 특정영역 유전자 Deep sequence하는 방법
알wndqhrghkrdls(과기인)  |  2019.01.21 10:46

NGS사용 하지 않고 특정영역 유전자  Deep sequence하는 방법이 있다면 조언 부탁드립니다.

당연히 NGS를 사용해서 확인하려고 했던 시켄스인데 위탁업체에 의뢰를 하면 보고서 제출 날짜까지 결과가 안나올 것 같아서 병행해서 시켄스를 확인해 보려고 합니다.

식물체를 이용하여 실험을 하였고, 식물체 뿌리에서 페노타입으로 확인했을 때 
정상유전자 : 비정상유전자 = 1:2000정도의 비율로 포함되어 있는 것으로 추정됩니다.

페노타입을 확인한 식물 뿌리로부터 genomic DNA를 추출하였고,
이 정상유전자보다 비정상유전자를 훨씬 많이 포함하는 DNA중에 일부만 정상유전자의 시켄스를 가지고 있다는 것을 확인하고 싶습니다.

NGS를 사용하지 않고 특정서열의 
Deep sequence를 1개월 내에 완료할 수 있는 방법이 있을까요?

이건 어떨까? 저건 어떨까? 하는 단순한 방법 제시라도 좋습니다.
부족한 저에게 지식을 좀 나눠 주세요. 


#NGS
 
#genomic DNA
 
#sequence
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
꽃개구리느림보  |  2019.01.21   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

1개월이면 NGS 실험 가능합니다.
샘플 수가 하나둘 적다면 다른 주문들과 같이 처리하게 되어서 일정이 늘어지게 되는 것이고요. 여러 회사에 일정을 확인해 보세요. 

NGS가 불안하면 클로닝해서 플라스미드를 시퀀싱 하는 것은 어떨까요. 1:2000이라고 했는데, 한 50개 정도 읽어보고 정상유전자가 나올 때까지 추가하는 식으로요. 

마지막으로 생각해 볼 수 있는 것은 시퀀싱 대신에 클론을 대상으로 PCR genotyping은 어떨까요? 제한효소 자리가 있다면 PCR-RFLP를 하던가, dCAPS 프라이머를 짤 수도 있을 겁니다. 

이렇게 쓰고 보니까 마지막 방법이 제일 저렴하고 빠를 것 같습니다. 


아웃사이더  |  2019.01.23    
답변하기
할인행사 광고 검색광고
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
COVID-19 진단 및 연구! TECAN과 함께하세요!! (9.30까지)
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
nanoString Panel Discount Promotion (~6월15일까지)!!! (6.16까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[TECAN] Reading과 형광 Imaging을 하나의 장비로 한 번에!! [Multi-mode mic.. (6.20까지)
케이비티 케이비티
[KBT] Rotator, Thermo Mixer, Ultrasonicator, Stirrer 등 기본 실험.. (6.30까지)
셀레믹스 셀레믹스
BTSeq Contiguous Sequencing 서비스 런칭 이벤트 - 무료 분석서비스(1만 마일리지) 제.. (6.30까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
[에펜도르프코리아] Eppendorf 2020 상반기 프로모션 안내 : 실험실 필수품 피펫,원심분리기,PCR.. (8.8까지)
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
3/6  좌우
93,20088,600
136,000129,200
870,000
468,000421,200
139,000132,100
6,0005,100
66,50063,200
92,30087,700
482,000433,800
339,400322,500
924,000
109,00098,100
47,20044,900
482,000433,800
23,00019,600
125,500119,300
773,000734,400
370,000333,000
493,000443,700
79,50075,600
49,00041,700
17,00014,500
739,000702,100
52,60050,000
최근등록   더보기 >
cre-loxp recombination으로 원하는 형질 쥐를 얻을 때 왜 꼭 교배를 시켜...   06.06
BamHI/HindIII 처리 시 issue...   06.06
Bacillus subtilis 접종후 발효 시키려고 합니다   06.06
FLAG   06.05
HPLC 질소가스 교체로 인한 문제   06.05
논문 오차율 계산   06.05
transformed cell 얼리는 방법   06.05
미생물은 이름이 같아도 생김새가 다르게 생기기도 하나요?;; (feat. S.mutans...   06.05
한 달 지난 액체 배지에 키웠는데 처음꺼랑 다른 결과가 나왔어요..(사진 봐주세요)   06.05
cell counting 계산 질문   06.05
라이카코리아
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크