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 전체 > Molecular Biology-RNA > Small RNA Analysis
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질문 miRNA primer 제작에 관한 질문입니다.
올챙이carpediem1(대학원생)  |  2018.11.23 20:39

안녕하세요. 
miRNA primer 제작과 관련하여 질문드립니다. 


현재 관련 논문들을 참고하여 프라이머 제작 후 RT-PCR을 진행하고자 하는데, 

예를 들어
5'-cuccuacauauuagcauuaaca-3' 의 mature mi-RNA가 존재한다면 
프라이머는 이의 역상보서열을 제작해야 할 것 같은데요.
그럼 5'-uguuaaugcuaauauguaggag-3'  (cDNA 폼은 무시한다면) 으로 제작하는 것이 맞지 않나요?

그러나 논문들을 검색해보면 
프라이머 리스트는 전부 그냥 5'-cuccuacauauuagcauuaaca-3' 의 본래 서열만을 제공하고 있습니다. 

제가 miRNA에 관한 공부가 아직 부족해서 생긴 오류일까요. 
아니면 생각한대로 역상보서열을 제작하는 것이 맞을까요?
혼동이 와서 전문가분들에게 조언 구합니다. 

답변 부탁드립니다.
감사합니다.

#miRNA
 
#primer
 
#RT-PCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
꽃개구리비루스  |  2018.11.24   
채택답변: 질문자가 채택한 답변입니다.

miRNA 자체를 PCR할 수는 없고 이를 RT-PCR을 통해 DNA로 전환하여 PCR을 돌리기 때문에 논문에서 보여준 방식이 맞습니다. miRNA가 인지하는 서열은 역상보서열이 맞습니다.m
아래 그림을 참고하세요. 이해하기 편하실겁니다.
프라이머와 miRNA의 서열이 동일함을 알 수 있습니다.

https://www.sigmaaldrich.com/content/dam/sigma-aldrich/articles/biology/qpcr-manual/mirna-rt-q-pcr-ab.jpg

올챙이carpediem1  |  2018.11.24   

답변에 감사드립니다.

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