[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
실험복 제공
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2 배너3
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-RNA > Small RNA Analysis
조회 2328  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 miRNA고수님들 도와주세요!: 논문결과, miR-200b VS miR-200b-3p
알(일반인)  |  2018.09.20 19:33
안녕하세요..
제 연구분야에 miR 결과를 함께 넣고싶어 막 miR에 공부하고 있는 사람인데요..

miR의 논문들을 보니 아래처럼 3 arm / 5 arm에 대한 명명까지 붙여놓은것이 있고 아닌것이 있었습니다..
------------------
miR-668
miR-219-1-3p
miR-615-5p
------------------

miR-668은 miRBase에서 찾아보면
miR-668-3p / 5p 모두 찾아져서.. 왜 저렇게 결과를 논해놨는지 잘 이해가 안됩니다 ㅠㅠ

그래서 제가 알고싶은것은, 
miR-668은..
위 논문에서 precursor miRNA를 의미하는 것일까요?
아니면 mature이지만 miRNA PCR결과에서는 종종 저렇게 써놓기도 하는건가요...?


miR연구자님들.. 답변해주시면 정말 감사드립니다..감사힙니다!
#miRNA
 
#PCR
 
#mature miRNA
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
제가 전에 학술 담당자분께 miRNA에 대해 PT를 배울 때
miRNA의 기능과 어떤 유전자에 작용하는지 정확하게 명명이 되어 있는 경우에는 
data base상에 5p, 3p로 명명이 되어있고
그렇지 않은 경우 * 표시로 명명 된다고 들었습니다.
그리고 qPCR을 할 때는 5p나 3p중 한 가지만 있어도 가능합니다.

지금 논문에 miRNA 결과를 넣고 싶은 거라면
해당 유전자를 찾고 그 유전자에 대한 control miRNA도 있어야 할 텐데
그 부분도 확인을 하시구요, 이 경우 Mouse / Human 인지에 따라 사용하는 
종류가 다르니까 확인해야 합니다.
그리고 처음이라면 기기가 본인 랩에 구비되어 있지 않거나 해서
공기계를 사용해야 할 텐데, 이 경우 기기 사용에 따라 결과가 달라지기도 합니다.

Taqman prove를 이용한 방법이 좀 더 정확하구요
Total RNA를 뽑아서 정량을 하고
RT-RCR을 할때 mature miRNA를 정량해 주는 KIT를 사용 한 후에
qRCR을 하면 됩니다.

사수가 없이 본인이 처음 해야 하는 거라면
사용할 기기 장비 회사에서 시약과 miRNA를 구매하고
그 과정에서 장비 사용법과 학술문의를 하는게 
시간과 오차를 줄일 수 있습니다.

개구리Q.E.D.  |  2018.09.20   
microRNA 생성과정 보시면 아시겠지만 기본적으로는 duplex 형태로 나오게 되고 둘 중 하나가 functional하게 gene silencing을 수행합니다.

이 때 primary 및 precursor form 기준으로 5'쪽에 가까운 strand를 miR-XXX-5p, 3'쪽에 가까운 strand를 miR-XXX-3p 라고 하고, 이 둘 중 AGO에 잘 들어가 gene silencing을 수행하는 특정 strand를 mature라고 합니다.

다만 이런 naming system은 miRNA 연구가 활성화되면서 정착된 것이라, 그전에 발견된 miRNA의 경우 function 자체로 유명해진 것들은 굳이 5p/3p를 붙이지 않고 고유명사처럼 쓰는 경우도 있습니다.

따라서 저런 경우는 그냥 miR-668-5p/3p 중 발현이 높은 쪽이거나 (AGO에 많이 들어가면 그만큼 안정적이라서) 맥락 상 특정 gene의 mRNA와 결합 가능한 strand를 의미합니다.
알DASgesunde  |  2018.11.07   
답변하기
할인행사 광고 검색광고
필코리아테크놀로지 필코리아테크놀로지
nanoString nCounter Sprint 연말 특별 50% 할인행사! (오직 1대 한정!) (12.27까지)
아반토퍼포먼스머티리얼즈코리아 아반토퍼포먼스머티리얼즈코리아
100% 미국산 FBS 1병 구매시 혈청 피펫 1박스(400개) 제공! (12.25까지)
바이오클론 바이오클론
(1+1증정) WB, IHC-P 하신다면!? Primary ab 구매시 secondary ab 무료로 드립니.. (12.27까지)
랩가이드 랩가이드
연말 남은 예산 땡처리 기회! 빅세일 ★Tube/Pipet/Tip/Spreader/Scraper★ 지금 구매.. (12.24까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
에펜도르프 프로모션:원심분리기,피펫,PCR장비,분광광도계,Mixer,Tube 다양한 혜택을 받으세요. (4.1까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[Tecan] 우수한 흡광전용 Microplate Reader & Microplate Washer를 저렴하게.. (1.7까지)
라이카코리아 라이카코리아
[보상판매 이벤트] 현미경 사용 중이신가요? Leica 현미경을 35% 할인해드립니다! (1.4까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
6/6  좌우
36,30034,000
75,50072,000
72,50069,000
56,90054,000
218,200207,000
93,70089,000
94,70090,000
118,900113,000
56,30053,000
130,00065,000
36,30034,000
172,100163,000
49,70047,000
78,00074,000
185,200176,000
186,300177,000
668,600334,000
89,60085,000
45,60043,000
121,700116,000
11,50011,000
117,600112,000
82,80079,000
118,900113,000
최근등록   더보기 >
전기영동 실험을 했는데..밴드가 여러개 나왔어요 왜그럴까요..?   12.15
abts assay 질문   12.15
cDNA가 이상해요.   12.14
ELISA assay 중 Wash step에서 Anti body 영향질문있습니다   12.14
미생물관련 질문사항   12.14
정상적인 thyroid 형태가 아닌가요?   12.14
transformation후 plasmid prep까지 시간을 좀더 단축 하는 방법이 있을...   12.14
단백질 정제 관련 질문드립니다ㅠㅠ   12.13
붕해시험 할때 보통 소화제는 오래걸리나요??   12.13
혈액에서 immunoprecipitation이 가능할까요?   12.13
기초과학연구원
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크