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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
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질문 oligo DNA 형광 측정 부분에서 질문 있습니다!
알ruin(대학원생)  |  2018.08.17 16:10
제가 현재 진행 중인 실험에서 20~30 base 사이즈의 oligo DNA를 사용하고 있습니다.
이 중 한가지는 FAM dye가, 하나는 Cy5 dye가 달려있는데요.
quencher를 동반한 실험에서는 생각한 경향성을 보여주며 반응하는데
이 두 DNA만 넣고 RT-PCR이나 plate reader로 형광의 kinetics를 보면 초반부에 Cy5의 경우 아래로 쳐졌다가 올라오고 FAM의경우 위로 솟았다가 내려오는 모양을 보여주더라구요.
단일 종류의 DNA이기 때문에 어떤 작용이 일어났다고 보여지지는 않는데 혹시 무엇때문에
이런 현상이 생기는지 아시는 분이나 짐작가는 부분 있으신 분 계신가요?
고민이네요.


추가적으로 DNA가 degradation 되었을 때 260 / 280 비 말고 다른 방법으로 간단히 알아볼 수 있는 방법 있을 까요? 이 분야를 시작한지 얼마 안되어 아는 게 많이 부족하네요 도움 부탁드립니다.
#DNA
 
#FAM
 
#Cy5
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