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왼쪽 그림의 마커도 이상한 것으로 보이네요...
일단 젤에 문제가 있어 보입니다.
다음의 것들을 체크해 주세요.
1. 1X TEA 버퍼에 아가로오즈를 녹였는가?
2. 보일링시 완벽하게 녹인것이 확실한가?
3. 틀에 붓고 완전히 굳을때 까지 기다린 것인 확실한가?
그래도 그러면 PCR이 문제인데, 글쎄요 입니다.
일단 물을 바꿔보시길 바라고 컨탐의 가능성이 있었던 것이 있으면 체크 바래요.
제가 옆에서 본것이 아니기 때문에 정확히는 모르겠네요.
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레벨6
Applied_Microbe
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18.08.04 18:16
Template DNA손상이나 PCR mixture 오염일거 같네요
PCR mixture 를 새거로 해보시고 (primer 까지) 동일하면 template 보관상 문제일것같네요 (너무 일률적이어서 mixture문제일것 같습니다만)
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레벨1
ThomasAquinas
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18.08.06 03:04
답변은 아니지만, 첫번째 젤 사진의 well에 하얀 부분은 뭔가요? DNA가 러닝이 안된건가요
아래쪽 사진에서 가자 오른쪽 샘플을 보면, 윗쪽 사진과 비교해서 봤을 때 정상적인 size에서 PCR product가 보이는 것 같군요.
DNA ladder 자체가 몇 bp인지 확실하게 구분되지 않아 사진간의 PCR product size가 똑같은지는 모르겠지만.....
만약 size가 동일하다고 한다면, 아래쪽 사진에서 보이는 PCR reaction은 DNA, 즉 template 가 문제일 가능성이 가장 커 보이네요.
PCR reaction 자체에는, 즉 PCR mixture 와 primer, PCR machine, DNA eletrophoresis에는 문제가 없다라는 것을 가장 오른쪽 샘플이 보여주기 때문이죠.
하지만, DNA ladder가 정상적으로 bp 구분되지 않는 것은 Gel % 또는 버퍼에 문제가 있어 보입니다.