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그런 경우 왕왕 있습니다. batch number를 잘 기억해 두었다가 결과와 함께 해당 회사에 claim 거세요.
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180801
(비회원)
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18.08.01 17:06
각 회사마다 enzyme 활성 및 buffer 조성은 약간의 차이들이 있습니다.
일반 Taq 계열의 enzyme 을 사용하신거라면 조건을(AT 온도 등) 수정하시면 band 확인이 어렵지는 않습니다.
간혹 실험 과정상에 문제가 있는 경우도 있습니다.
Chemical-mediated hot start PCR enzyme 은 Pre-denaturation time이 10분 이상인 경우가 있습니다.
일반 Taq 계열 enzyme에서 band가 증폭되어도 Pfu 계열 enzyme에서 증폭이 어려운 경우도 있습니다.
pre-mix 제품을 사용하셨다면, 각 회사의 최적 enzyme 활성으로 mix 된 제품입니다. 실험 조건을 수정해서 진행했는데도 증폭이 어려웠다면 구매하신 A 회사에 클레임 문의를 해보시는게 좋을 것 같습니다. 간혹 enzyme의 문제로 증폭이 안 될 수 있습니다. 구매하신 회사에서 QC test 를 요청해보세요.
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레벨5
Marine
(대학원생)
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18.08.08 19:50
뭔가 생산된 Batch 에 따라 잘못된 것 같지는 않고
X, Y 라는 서로 다른 유전자를 타겟 하는 primer-set 있을 때
A 제품은 X 는 증폭이 전혀 안되고, Y 는 증폭이 잘 되고
B 제품은 X 도 Y 도 증폭이 모두 잘 되고
이런 경우는 어떻게 해석해야 할까요?? ㅠ
두 Primer 모두 일반적인 20mer 가량의 primer 이며, degenerative sequence 가 몇 개 bp 씩 있습니다..