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 전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR
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질문 PCR 프라이머 짤 때
알쭈바꾸아(과기인)  |  2018.05.15 19:11
PCR을 하기 앞서, 정해진 DNA에 프라이머를 짜야하는데 프라이머를 짜기 전에 제가 증폭하고 싶은 부분을 정해야하잖아요

2kb정도 되는 sequence를 가지고 있는 dna에서 어느 부분을 타겟으로 해야하는거죠..? 제가 임의로 정하는건가요? 아니면 방법이 따로 있는건가요????

요약해서 질문드리자면 증폭하고 싶은 부분을 찾는 방법이 궁금합니다
#pcr
 
#sequence
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리강시  |  2018.05.15   
실험의 목적에 따라서 달라집니다.

만일 어느 염기서열 또는 유전자가 있는지 파악하는 것이 목적이라면 프라이머 짜는 프로그램이 있으니 그걸 쓰면 됩니다.

만일 유전자를 클로닝 하거나 발현 등의 목적으로 유전자 전체 또는 특정 부위를 클로닝해야 한다면 어쩔 수 없이 님 임의로 짜면 됩니다.
개구리Lacticacid  |  2018.05.15   
단백질 발현을 목적으로 ORF 앞의 promoter까지도 증폭하는 등의 실험 방향에 따라 프라이머 디자인 방법이 다양합니다.

실험목적을 잘 알고 있어도 증폭 부분에 대해 이해되지 않는다면, 선배님 혹은 교수님께 이번 실험을 위해 프라이머를 짜봤는데 이 부분과 이 부분을 "이러이러한 이유로" 증폭하려고 합니다. 라고 잘 정리해서 여쭤보면 간단합니다.  학위과정 중 또는 포닥이시거나 어떤 과정이신중인지 모르겠으나, 제가 교수님이거나 센터장이라면 이렇게 로직과 함께 실험 방향을 회의하는 것을 좋아할 거라 생각합니다.
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