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질문 종분석 PCR 방법에 관하여 질문드립니다!
알서머(대학생)  | 2018.04.19 14:08
안녕하세요

해조류관련실험을 진행하고 있는 대학원생입니다.

채집해온 해조류로 실험을 진행하기 전에 해당 생물종의 정확한 종정보를 알고자 분석을 진행하고싶습니다.

해조류에 관한 primer 정보가 많이 없기에 그냥 식물 DNA barcode인 rbcL, ITS 이용해서 간단하게만 확인해보고 싶은데 종수준까지 분석이 가능할까요? 둘 중 하나만 해도 된다면 어떠한 gene이 더 자세한 결과를 얻을 수 있을까요?

그리고, 해당 gene primer sequence를 어디에 가면 알 수 있을까요? 논문말고 universal한 primer 정보를 알수 있는 곳이 있다면 알려주시길 부탁드립니다.






#종분석
 
#해조류
 
#primer
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
호롤룰루  |  2018.04.19    

해조류는 잘 몰라서 여쭙고 싶습니다.

16s rRNA쪽으로 해조류는 종간분석이 어려운지요?

개구리Marine  |  2018.04.19   
제가 알고 있는 Primer-set 은 없지만

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0169534714002274

위 논문의 Figure1 과 그와 관련된 Reference 를 참고 하시면 도움이 되실 것 같습니다.
꽃개구리Applied_Microbe  |  2018.04.19   
해조류는 진핵생물이니 16s 는 안됄꺼에요
18s나 ITS 가 사용될꺼에요
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