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질문 계통수 그릴 때 비교균주(?) 선택하는 방법이 궁금합니다.
알협조섭조(일반인)  | 2018.01.30 00:56
에너지자원공학을 전공하고 있는 박사과정 학생입니다.
미생물 관련 전공이 부족한 상황에서 혼자 공부하다가 어려운 부분이 있어 질문드립니다.

토양으로부터 특정 미생물을 분리 및 동정한 후 16S rRNA분석을 의뢰하여 유전자 정보를 얻었습니다. 그리고 인터넷을 통해 MEGA7이란 프로그램을 이용하여 phylogenetic tree를 그릴 수 있는 것 까지 확인하였습니다. NCBI 사이트에서 제가 분리한 미생물과 유사한(?) 미생물종도 확인했고요(아래 그림 참조).그런데 아래의 그림에 나와있는 미생물의 유전자 정보를 제 미생물의 유전자 정보와 취합하여 파일을 만든 후 계통수를 그렸더니, 모두 비슷한 미생물이라 그런지 제가 논문에서 봤던 그림들과는 너무 다릅니다.

궁금한 내용은...
1. 부족한 제 지식으로는 아래 그림에 나와있는 미생물들만으로 그림을 그리는 것이 아닐 것 같다는 결론을 얻었는데...일단 이것이 맞는지요?
2. 만일 아래의 미생물은 모두 유사하기 때문에 다른 미생물을 선별한 후 계통수를 그린다면 어떤 기준으로 다른 미생물을 선택하는지 궁금합니다.
3. 아래 그림에 나와있는 미생물 중에서도 특정 미생물을 선별할텐데 가장 상위에 있는 미생물을 선택하는건가요?

미생물 전공자를 만날 기회가 없어 의견교환을 해본적이 거의 없습니다. 제가 지금하고 있는 질문이 전공자가 봤을 때 허무맹랑한 소리가 아닐까 하는 걱정만 앞섭니다. 부디 선배님들의 넓은 아량으로 조언해 주시길 부탁드리겠습니다. 감사합니다. 


upload image
#계통수
 
#mega7
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
학부생  |  2018.06.05    
빨리 아무나 답장 해주세요 ㅠㅠ 현기증난단말이에요
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