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레벨5
유전학도^^v
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17.10.30 18:23
NCBI blast를 하면 NCBI 데이터베이스 상에 등록되어 있는 데이터베이스에 대해서 blast를 합니다.
Identity는 정확히 일치하는 비율을 얘기하는 건데,
어디까지나 기존에 등록돼 있는 데이터와 비교하여 그렇다는 겁니다.
보존이 잘 되어 있는 sequence라면 3%로 인해 종이나 속이 완전이 다른 것일 수도 있습니다.
해당 sequence에 대한 추가적인 정보를 찾아보셔야 할 것 같습니다.
참고하세요.
유전자는 기능이 극히 제한된 경우 매우 conserved 되는 경향이 있습니다.
하지만 특이한 기능이 아니라면 염기서열이 많이 달라지기도 합니다.
그래서 분류 동정에 시용하는 유전자의 종류가 적습니다.
가령 16S rRNA 라던가 RNA polymerase 라던가....
분석에 사용된 엽기서열만을 이용하여 결론을 말해야 하는 상황이라면 "내 균주와 NCBI 염기서열 비교로 찾은 어느 균주는 사용한 염기서열로만 판단할 때 97% 유사성을 띠는 것으로 사료된다" 정도로 말할 수 있겠네요.