[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
웨비나 모집
스폰서배너광고 안내  배너1
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-RNA > Small RNA Analysis
조회 1084  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 unique sRNA
알이기적(일반인)  |  2017.06.12 14:09
첨부파일 파일첨부: 캡처.JPG (42 KB)
이미지 첨부파일
 A total of 11 999 328 raw reads were generated by the high throughput Illumina platform. After processing of the primary reads, 10 510 914 (87.6%) total clean reads, including 2 999 700 unique reads, were counted for the mixed tissue sRNA library (Table 1).
The sequencing output was uploaded to NCBI SRA archive (accession no. SRR1731699). Due to the lack of the opium poppy reference genome or related-organism genome data, such unique sequences were mapped to the Arabidopsis thaliana genome, using SOAP2 (Li et al., 2009). 
12 550 (0.42%) unique reads were considered as miRNAs.

양귀비 miRNA에 관한 논문을 읽는 중인데
여기서 말하는 
unique reads, Unique sRNA가 어떤의미인지 감이 오지 않습니다ㅠ

그리고 "
A total of 316 miRNAs were identified, belonging to 111 conserved miRNA families."라고 하면 여기서 316 miRNAs는 모든 식물에서 발견되는 miRNAs를 뜻하는 것인가요? 만약 이 뜻이 맞다면 316 miRNAs를 제외한 miRNA가 unique miRNA가 될수 있는거 아닌가요?

답변 부탁드립니다ㅠㅠ
#unique
 
#sRNA
 
#miRNA
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
NGS 시퀀싱 라이브러리를 제작하는 여러 방법은 대체로 PCR로 증폭하는 단계가 있습니다. 이 라이브러리 단편이 시퀀싱되면 같은 시퀀스를 갖는 read가 됩니다. unique read란 이렇게 증폭으로 인해 생기는 중복 서열을 제외한 read를 의미합니다. Illumina의 sRNA 라이브러리 관련 기술문서를 참조하세요.
이 unique read들을 모아서 조립한 것이 unique sRNA가 될테고요, 

miRNA는 전형적인 구조를 가지지 않습니까? 거기에 따라서 동정된 것이 316개의 miRNA이고, 서열의 유사도에 따라서 miRNA 유전자군 중 111의 유전자군으로 분류했다는 겁니다. 
개구리느림보  |  2017.06.14   
답변하기
할인행사 광고 검색광고
싸토리우스코리아바이오텍 싸토리우스코리아바이오텍
피펫 3+1 & 구매 인증샷 이벤트 (10.31까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
5/6  좌우
286,700
113,500108,000
231,000219,000
121,700
50,50048,000
101,90097,000
79,80076,000
82,800
107,200102,000
286,700
180,700172,000
286,700
123,900118,000
668,600334,000
137,600131,000
218,200
56,70054,000
49,700
286,700
130,00065,000
231,000219,000
286,700
286,700
144,900138,000
최근등록   더보기 >
고갈 시간을 넘겨버렸는데 큰 문제가 있을까요..   08.21
incubator 청소 뒤 무균테스트   08.21
toxin solution 방법   08.21
폐기물 autoclave 돌리고 버릴때 질문 있습니다.   08.21
sec analysis 에서 size가 잘못 나올 수도 있나요?   08.21
DNA sequencing 해석하는데 질문이 있습니다.   08.21
10% deoxycholate 용액 만들어보신분   08.21
Membrane Filter & Filter Top   08.21
파라핀 블럭 section   08.21
AMES TEST 균주 사용 관련 문의   08.21
오송첨단의료산업진흥재단
투표진행
Q. Cell line 배양시 FBS 제조사마다 차이가 있다고 생각하시나요? 동물세포 배양에서 특별히 요구되는 FBS가 아니고 실험자가 많이들 사용하는 셀라인의 경우 제조별 FBS가 세포 배양에 영향을 미칠까요? 물론 제조사의 endotoxin의 level은 같다라고 가정하고 질문을 드립니다.
참여하기
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS