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 전체 > Molecular Biology-RNA > Small RNA Analysis
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질문 unique sRNA
알이기적(일반인)  |  2017.06.12 14:09
첨부파일 파일첨부: 캡처.JPG (42 KB)
이미지 첨부파일
 A total of 11 999 328 raw reads were generated by the high throughput Illumina platform. After processing of the primary reads, 10 510 914 (87.6%) total clean reads, including 2 999 700 unique reads, were counted for the mixed tissue sRNA library (Table 1).
The sequencing output was uploaded to NCBI SRA archive (accession no. SRR1731699). Due to the lack of the opium poppy reference genome or related-organism genome data, such unique sequences were mapped to the Arabidopsis thaliana genome, using SOAP2 (Li et al., 2009). 
12 550 (0.42%) unique reads were considered as miRNAs.

양귀비 miRNA에 관한 논문을 읽는 중인데
여기서 말하는 
unique reads, Unique sRNA가 어떤의미인지 감이 오지 않습니다ㅠ

그리고 "
A total of 316 miRNAs were identified, belonging to 111 conserved miRNA families."라고 하면 여기서 316 miRNAs는 모든 식물에서 발견되는 miRNAs를 뜻하는 것인가요? 만약 이 뜻이 맞다면 316 miRNAs를 제외한 miRNA가 unique miRNA가 될수 있는거 아닌가요?

답변 부탁드립니다ㅠㅠ
#unique
 
#sRNA
 
#miRNA
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
NGS 시퀀싱 라이브러리를 제작하는 여러 방법은 대체로 PCR로 증폭하는 단계가 있습니다. 이 라이브러리 단편이 시퀀싱되면 같은 시퀀스를 갖는 read가 됩니다. unique read란 이렇게 증폭으로 인해 생기는 중복 서열을 제외한 read를 의미합니다. Illumina의 sRNA 라이브러리 관련 기술문서를 참조하세요.
이 unique read들을 모아서 조립한 것이 unique sRNA가 될테고요, 

miRNA는 전형적인 구조를 가지지 않습니까? 거기에 따라서 동정된 것이 316개의 miRNA이고, 서열의 유사도에 따라서 miRNA 유전자군 중 111의 유전자군으로 분류했다는 겁니다. 
꽃개구리느림보  |  2017.06.14   
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