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PFGE는 pulse time이 젤루 중요합니다.
제가 전에 냈던 데이터 사진을 보냅니다.
다운받아서 보시면 도움이 될겁니다.
(A) PFGE at 180 V for 20 h with a linearly ramped pulse time of 10 s to 20 s. (B) PFGE for 18 h with a linearly ramped pulse time of 1.5–5 s. (C) PFGE for 12 h with a linearly ramped pulse time of 1–1.5 s. Lanes: 1 and 4, phage lambda DNA concatemers; 7, HindIII-digested lambda DNA; 2, 5, and 8, PmeI digestion; 3, 6, and 9, PacI digestion .The sizes of markers are given in kilobase pairs.
10-300kb가 목적이라면 5초-20초, 180V, 20시간정도 하면 될것 같군요.
buffer는 1X TBE.
agarose는 seakem LE 1%.
기기는 CHEF DR-II.