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 전체 > Molecular Biology-RNA > etc.
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질문 RNA추출시 식물을 더 갈고 덜 갈고의 차이에 따라 RNA농도나 순도의 차이가 생길 수 있을까요?
알안녕하이(대학생)  |  2017.05.10 15:06
 제가 이번에 실험실 들어와서 처음으로 하는 실험이 트리졸을 이용한 RNA 추출실험이였는데요.
들어온지 얼마 안되어서 농도랑 순도 결과가 잘안나와가지구..
외부에서 들어온 이물질 때문에 농도도 낮고 순도도 1.3, 1.2 막 이렇게 낮게 나왔거든요ㅠ

그래서 다른 식물로 많이 연습해보고 나서 다시 실험해야할 식물로 실험하고 나니깐 순도가 1.7~1.8로 잘 나오고 농도도 나쁘지 않게 나왔어요.

그런데 제가 손에 힘이 별로 없어서 식물을 막자사발에 갈 때 좀 다른 사람들에 비해 열심히 하지 않았던것같은데요..
언제 한번 다른사람보다 액체질소를 한번 더 넣어서 좀 더 갈고 측정했더니 순도가 좀 올라갔었거든요
그래서 그 뒤로 더 열심히 갈았더니... 순도가 좋게 나왔었는데
지난 lab meeting 때, 막자로 더 많이 갈았더니 순도가 높게 나왔다라고 말했다가
교수님께서 진짜로 그러한지 논문이나 보고서 같은데에 자료가 있는지 찾아보라하셨거든요ㅠㅠ
이걸 근데 뭐라고 써야 나올지 모르겠어가지구ㅠ 일단 여기에 올려봅니다아ㅠㅠ

식물을 더 많이 갈고 덜 갈고에 따라 RNA 농도나 순도값이 다르게 나올 수 있을까요?ㅜㅠ
진짜로 그러한지 자료를 찾을 때 뭐라고 쳐야 찾을 수 있을지 알려주시면 정말 좋을것같아요ㅠㅠ
도움을 주세요ㅠㅠㅠ
#RNA 추출
 
#막자사발
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리Marine  |  2017.05.10   
 흠... 그냥 상식적인게 아닐까요?
그런걸 비교해 본 논문이 있을까.. 싶네요

각설탕이 물에 녹는 것 보다 가루설탕이 물에 훨씬 잘 녹고 빠르게 녹는 것 처럼
조직도 덜갈려서 Cell 들이 뭉쳐 있는 것 보다 잘 갈려서 더 가루가 될 수록 표면적이 높아져서
Trizol 에 잘 녹아날테니까요..
개구리캐틀  |  2017.05.11   
 DNA, RNA추출에 있어 순도와 농도의 차이는 좀 다르게 봐야 되죠...

식물에서 RNA추출하려할때... 막자사발에 덜 갈고 더 갈고의 차이에 따라 추출되는 RNA의 농도에 영향을 미치겠으나, 순도에는 아무런 영향이 없습니다.
농도는 그양이 얼마나 많고 적느냐 이기에  샘을을 많이 사용했다면 농도는 올라 가겠지요...

하지만 순도는 다릅니다.
순도는 얼마나 깨긋하냐 아니냐의 차이이죠....
이건 샘플의 양이 많다고 순도가 올라가고 적다고 순도가 떨어지고 하진 않습니다.

순도의 차이가 난다는 것은 님의 그만큼 숙련도가 없다는 말이 됩니다.
실험하는 중에 무의식적으로 했던 행동이 추출의 순도에 영향을 미쳤을 겁니다.
그러니 어떨때는 순도가 좋게 나왔다가 어떨 때는 낮게 나오다 하는것이죠..
흔히 실험 초보가 많이 하는 실수 이기도 합니다.

lab meeting에서 다 많이 갈아서 순도가 순도가 높아 졌다는 말을 들은 교수님께서는
공부좀하라고 논문이나 보고서 찾아보라 하신것 같네요...ㅎㅎㅎㅎㅎ
개구리A'ANE  |  2017.05.12   
순도와 농도를 헷갈리신게 아닐까 싶고


식물샘플은 애초에 Lysis가 어렵고 사람손으로 하는건 항상 variation이 생기기 때문에


보통 관련실험을 많이하는 랩에선 BeadBeater를 이용해서 균등하게 Lysis 시키고 실험을하죠. Homogenizing단계에서 동일하게 동일한 샘플종류들을 동일한 양만큼했는데도 결과 yeild가 다르다면 그건 테크닉 문제라고 봅니다.


그래서 요청 kit제품은 Lysis부터 Isolation까지 쭉 진행할 수 있게 구성된 제품도 있어요(http://www.zymoresearch.com/dna/microbial-environmental-dna-isolation-1/soil-fecal-plant-dna/quick-dna-plant-seed-miniprep-kit) 참고하세요~
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