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 전체 > Molecular Biology-Protein > Extraction/Isolation
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질문 항원항체 반응 후 protein에 농도에 따른 0.01XPBS pH 변화에 대한 질문
알바이오초보박사과정(대학원생)  |  2017.04.10 21:15
 안녕하세요.
바이오에 처음으로 몸은 담근 반도체 랩실을 다니고 있는 박사과정학생입니다.

저는 전자공학부 출신으로 반도체로 단백질 혹은 pH를 검출해내는 연구를 하고 있습니다.
(바이오에 대한 지식은 생2/화2 (08학번입니다) 에 멈춰있습니다.)
현재 실험 설계를 아래와 같이하고 있습니다. 한번 확인해주시면 감사하겠습니다.


1. 실험 목적 : Receptor-target이 반응한 molecule의 농도를 용액의 pH 변화로 알아낸다.
2. 실험 가설 : 0.01 X PBS에 용해된 Receptor와 target이 반응하여 하나의 단백질을 만든다면, PBS 용액에서의 pH 값이 변화할 것 이다. 
3. 실험 방법 
 - Receptor농도와 target 농도에 따른 시료를 준비한다.
 - PBS에 녹인 Receptor의 농도에 따른 pH(1)를 측정한다.
 - target을 넣은 후 충분히 반응시킨후 농도에 따른 pH(2)를 변화를 측정한다.

4. 결과 및 토의
 - pH(2)-pH(1)은 항상 양수였다.
 - receptor와 target molecule 농도가 높을수록 pH(2)-pH(1)의 값은 커졌다.
 - 즉, receptor-target이 반응한 단백질의 PI 값은 pH(1)보다 클 것이다. 혹은 PBS에서 receptor-target이 반응한 단백질의 pH 값은 양수이다. 
 - 예상되는 또다른 가설은 Receptor-target이 결합시 OH-가 탈락하여 혹은 H+ 받아 0.01XPBS의 pH를 약간 올린다. 

5. 의문점.
 1) 위의 실험설계가 타당하려면 어떠한 추가적인 가정이 필요한가?
 2) PBS에 단백질이 녹아서 용액의 pH를 변화시킬 수 있는가?
 3) 2)이 맞다는 가정에서 PBS pH의 변화(pH(2)-pH(1))가 0.2 ~ 1이 변화하였다면 정량적으로 믿을 수 있는가?
 4) 해당 실험을 완성시키기 위한 백그라운드를 이론은 무엇이 있는가?

이렇게 입니다. 전자공학부 출신이다보니 백그라운드가 약해서 위의 실험이 타당한지를 모르겠네요. 의문점도 많구요.. 다만 여기서는 교수님도 그렇고 속 쉬원하게 말씀해주시는 분들이 없다보니 질문 올립니다. 
위의 실험이 메인이 아니다 보니 어느정도 논리만 맞으면 될 것 같긴한데..감이 없다보니..봐주시면 감사하겠습니다.
#PBS
 
#Protein
 
#항원항체
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