실험 Q&A Mol. Biol.-RNA > Small RNA Analysis
phylogenetic tree에 관해 질문있습니다.
레벨1 벌레
세균의 16s rRNA 염기서열을 가지고 Phylogenetic tree를 그리는 방법을 최근에 배웠습니다. phydit, bioedit, mega6, chromapro 등등을 이용했는데요...
ezcloud를 통해 검색했을 때 염기서열의 유사도가 가장 가까웠던 아이가 정작 tree에선 가장 멀게 배치되었습니다. 이게 왜 이런지.. 이해가 안되네요... 설명좀 부탁드리겠습니다 ㅠ_ㅠ;;
염기서열의 유사성이 높을수록 당연히 가까워야 하지 않나요? tree가 잘못되었을까요??
두번째로 bootstrap을 1000번 이상 돌린 것과 안돌린 것의 tree 모양의 차이가 있던데.. 뭐가 더 정확하다고 할 수 있는지 (당연히 bootstrap을 돌린 경우가 더 정확하다고 생각합니다만... 원리를 잘 모르겠습니다.)
질문 드린 두 가지 중 한개라도 알고계신 분이 계신다면... 꼭 답변 부탁드립니다. 감사합니다...
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