실험 Q&A Mol. Biol.-RNA > etc.
Transcriptome DEG 실험에서, expression level 확인시.. qPCR vs dPCR
shjang (비회원)
안녕하세요
새로운 실험을 진행하려고 디자인 중인데, 실험적 method 장단점 비교 관하여 질문드립니다.
타겟 종에 대한 de novo RNA-seq 분석 후, 조건에 따른 DEG (differentialy expressed gene) 분석을 진행하려고 합니다.
이때, unigene에 대한 발현량 컨펌을 PCR로 진행하려고 하는데요. 흔히 사용하는 qPCR 이용말고, digital PCR을 사용하면 무조건(?) 상대적(?)으로 더 좋다고 볼 수 있을까요?
digital PCR 기반 RNA 발현량 비교시, qPCR 기반에 비하여 더 세밀한 정량값, new technology로 인한 저널에서 관심 등을 받을 수 있을까요? 도리어, 아직까진 확실히 컨펌되지 않은 방법인가요? 이리저리 알아보고 있다가, 여기에도 질문을 드립니다
감사합니다!
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