실험 Q&A Plant Biology > Plant DNA RNA Isolation
식물 genomic DNA의 갈색(검정) 색소 제거 방법을 아시는 분 계신지요
식물연구자 (비회원)
안녕하세요.
약용식물로부터 genomic DNA를 CTAB 방법으로 추출하고 소규모 NGS 분석하고 분자마커를 제작하는 실험을 하고 있습니다.
그런데, 어떤 잎재료 (건조되거나 녹색잎이 아닌)로부터 genomic DNA를 분리하면, phenol:chloroform(PC)을 여러번 처리해도 마지막 DNA pellet이 갈색이고, 이를 TE buffer에 녹인후 다시 PC를 여러번 처리하도 다시 ethanol down해도 genomic DNA solution으로부터 갈색 색소을 제거할 수가 없습니다.
Agarose gel running으로는 genomic DNA가 뽑힌 것을 확인할 수 있는데, NGS용으로는 부적합하게 나옵니다.
혹시 식물 genomic DNA에 오염된 갈색(검정) 색소 제거 방법을 아시는 분이 계시면 조언 좀 해주세요.
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