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 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 980  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 NGS 질문..
ㅁㄴㅇㄹ  |  2016.11.18 11:17
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)

NGS를 할 때 DNA fragment 들이 cluster를 이루고

거기에 상보적인 특정 염기가 가서 붙을 때마다 형광이 나온다고 하던데

Sanger랑 다르게 이거는 특정 염기가 붙었을 때 마다 DNA 합성이 멈추는게 아니라

계속적으로 주르르륵 염기들이 붙는건가요?

그니까 비디오처럼 한번 쭉 찍으면서 형광색 변하는것만 분석하면 되는건가요?


근데 이러면 궁금한게 아무리 같은 서열의 cluster라고 하더라도

서로 염기서열이 붙는 속도가 variation이 있을것 같은데

예를 들어 AGTCA 이런 시퀀스의 cluster가 있을 때

어떤 놈은 AGTC까지 되는 동안 어떤 놈은 AG까지 밖에 안되었을 수도 있는데

cluster 내부에서 형광이 다양하게? 나타나게 되는거 아닌가요;;

제가 뭘 잘못생각하고 있는지 알려주시면 감사하겠습니다.








#NGS
 
#sequencing
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아주 쉽게 설명 드리자면,
실시간으로 동영상을 찍는게 아니라,
염기 하나 붙이고, 사진 찍고, 다음 염기 붙이고, 또 사진찍고... 이렇게 진행된다고 생각하시면 될 것 같습니다.^^
JI  |  2016.11.18    
제 기억에 누군가 붙지 않는건 워싱단계에서 사라지게 한다고 했던 것 같은데 스쳐지나가던 기억이라 확실하지가 않네요

http://ngenebio.com/rnd/ngs
그림과 설명으로는 cluster level로 분석이 된다는데....
저도 궁금해져서 혹시 답 찾으시면 올려주세요 저도 한번 찾아보겠습니다
알BInfo  |  2016.11.21   
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