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전체 > Molecular Biology-DNA > PCR/RT-PCR/Q-PCR |
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조직과 cell에서 RT-PCR 할때 band가 차이나는 이유 |
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답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의) |
제가 조직에서 RNA를 뽑아서 cDNA합성하고 RT-PCR을 해서 target gene를 본경우와 cell에서 똑같이 RNA를 뽑아서 RT-PCR을 하고 똑같은 target gene을 보았는데
조직에서 뽑은것은 원래 알고있는 사이즈에 밴드가 깔끔하게 나옵니다... 그런데 cell에서 뽑은거는 제위치에 나오지도 않고 다른 부분에 multi band가 뜹니다...
조직과 cell에서 같은 target gene을 보았는데 다를수 있나요?? 아니면 primer문제 인가요???ㅠㅠ |
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본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다. |
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유전학도^^v | 2016.10.13
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몇 가지 가능성을 생각해 봅니다.
1. 조직과 cell 간의 발현 차이로 인해, 다시 말해 cell에서 발현이 훨씬 낮아 non-specific하게 다른 유전자가 증폭되었을 가능성.
2. Alternative splicing에 의해 다른 형태의 isoform이 존재할 가능성.
3. 조직 특이적 발현 양상이 강해 조직 수준에서는 발현되나, cell 수준에서는 발현이 매우 적거나 안 될 가능성.
확인해 보는 방법은 해당 band를 sequencing 해 보는 겁니다. (T-vector에 cloning해서 sequencing 맡겨 보세요)
오히려 조직에서 나오는 band가 가짜일 수도 있습니다.
참고하세요. |
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