[DEBUG-WINDOW 처리영역 보기]
즐겨찾기  |  뉴스레터  |  오늘의 정보  |  e브릭몰e브릭몰 회원가입   로그인
BRIC홈 실험
실험복 제공
스폰서배너광고 안내  배너1 배너2
전체보기 안전점검 논문교환 LABox
 전체 > Molecular Biology-DNA > Sequencing
조회 2434  스크랩 인쇄하기 주소복사 트위터 공유 페이스북 공유 
질문 안녕하세요 sequencing 검사결과를 받았는데 해석좀 도와주세요.
알바그지  |  2016.07.25 21:59
제가 아직 잘 몰라 질문답변을 위한 정보가 많이 부족할 수 있습니다...ㅜㅜ
sequencing 검사 결과를 의뢰하였고 검사결과를 받았습니다.
프로그램을 돌려서 확인해본 결과
모든 sequence가 틀린곳 없이 성공이었는데요...
ㅠㅠ
맨끝 제한효소 site가 한곳이 이상하네요
저는 Xho1을 사용하였는데요
Xho1은 CTCGAG 인데 sequencing결과 CTTGAG로 나왔네요..
너무 당황스러운데 이게 뭘 뜻하는지 아시나요?
왜 이렇게 결과가 나왔을까요??
제한효소 처리하고 전기영동을 통하여 band를 확인했을때는
다른 잡 band가 나오긴 했지만.. insert와 vector 사이즈의 band를 확인했습니다.
이것을 보면 안잘리진 않은거 같은데요.. (또 궁금한게,, vector는 3.0kb, insert는 1.3kb인데
2000쯤에서 진한 band가 나타나네요 sample을 3개로 했는데 모두 나타났습니다.)
어찌된일일까요.. 애초에 primer가 잘못인가 싶어서 확인해보니 제대로 였습니다.
일단
sequencing peak사진을 첨부합니다..
upload imagepeak가 이상한것만 알겠고 그외 다른 정보는 아직 미숙해서 잘모르겠네요ㅠㅠ 도와주세요
저 peak사진에서 80부근에
CCTAGA가 문제의 잘못나온 Xho1 site입니다. (상보적으로 읽은거)
음.. 무슨이유로 보시나요?
원래대로라면 sequencing 확인 후 성공적이었다면, 다른 vector에 집어 넣은 뒤
tramsformation을 시작하려 했습니다. 그대로 진행해도 괜찮을까요..?

많은 답변 부탁드립니다.
#DNA cloning
 
#seqeuncing
답변하기
답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
사진만 봐서는 정확히 답변드리기 어려우나 sequencing시 양끝. 즉 앞쪽 100bp 와 뒤쪽 100bp는 신뢰구간이 아닙니다. pcr product를 sequencing 하신거라면 ligation후 vector를 full sequencing 해보시기 바랍니다.
개구리Daegu*  |  2016.07.26   
90bp 까지는 잘라버리고 읽으세요.
대왕개구리강시  |  2016.07.26   
ligation까지 하고 full sequencing 보낸거에 대한 답변이에요..
Nhe1-///-Xho1이건데요
저게 reverse 쪽이라서
저 80부근이 CTCGAG가 원래 Xho1부근이에요
근데 지금 다 잘 나와는데 저부분만 CTTGAG에요
ㅠㅠ
알바그지  |  2016.07.26   

그럼 저 위치가 3' 쪽이라면, vector의 3' universal primer로 거꾸로 한번 읽어 주셔서 대조해 보시면 됩니다. 혹은 5' 쪽이라면 5' universal primer로 읽어 주세요.

개구리Daegu*  |  2016.07.26   

아참 그리고,, 혹여 universal primer로 읽었는데 나온 결과가 위에 올린 data라면, 벡터에서 MCS앞쪽에는 promoter가 존재하는데요, 이러한 promoter를 읽을 수 있는 primer들이 존재하며 이러한 primer를 사용하여 sequencing 에 이용하기도 합니다.

개구리Daegu*  |  2016.07.26   
답변하기
할인행사 광고 검색광고
랩가이드 랩가이드
연말 남은 예산 땡처리 기회! 빅세일 ★Tube/Pipet/Tip/Spreader/Scraper★ 지금 구매.. (12.24까지)
에펜도르프코리아 에펜도르프코리아
에펜도르프 프로모션:원심분리기,피펫,PCR장비,분광광도계,Mixer,Tube 다양한 혜택을 받으세요. (4.1까지)
엠피바이오메디칼스코리아 엠피바이오메디칼스코리아
세포가 비실비실 하다면, 마이코플라즈마 오염을 확인하세요! 마이코플라즈마 PCR detection Kit.. (12.31까지)
그린메이트바이오텍 그린메이트바이오텍
[Tecan] 우수한 흡광전용 Microplate Reader & Microplate Washer를 저렴하게.. (1.7까지)
라이카코리아 라이카코리아
[보상판매 이벤트] 현미경 사용 중이신가요? Leica 현미경을 35% 할인해드립니다! (1.4까지)
프리미엄 등록안내
외부제휴사 광고 AD
e브릭몰
βeta
3/6  좌우
82,80079,000
56,90054,000
36,30034,000
286,700272,000
231,000219,000
186,300177,000
45,60043,000
38,10036,000
172,100163,000
234,600223,000
130,00065,000
78,00074,000
36,30034,000
218,200207,000
75,50072,000
121,700116,000
118,900113,000
49,70047,000
56,30053,000
11,50011,000
245,100233,000
123,500117,000
668,600334,000
185,200176,000
최근등록   더보기 >
사후 24시간 이내 돼지 삼겹살   12.09
히알루론산 확인 시험 원리   12.09
암세포에서 세포생존율이 증가한 이유가 궁금해요?   12.09
PCR product를 Enzyme reaction했을 때 band가 자꾸 사라져서 질문...   12.08
mutation후 protein activity질문   12.08
NH3를 NH4OH로 만들기 ㅜㅜ도와주세요 ㅜㅜ   12.07
transformation 후 plasmid purification에서 저조한 값........   12.07
ATA녹이는데 NH4OH 는없고 NH3 만있어요 ㅜㅜㅜ질문있어요ㅜ ㅜㅜ   12.07
통계 문의 드립니다.   12.07
SDS PAGE gel 을 내릴때   12.07
에펜도르프코리아
투표진행
Q. 웨스턴 진행시 잘나오는 항체 얼마나 희석해서 사용하나요?
참여하기
ZEUS
위로가기
실험 홈  |  실험FAQ  |  실험 문의 및 제안
 |  BRIC소개  |  이용안내  |  이용약관  |  개인정보처리방침  |  이메일무단수집거부
Copyright © BRIC. All rights reserved.  |  문의 member@ibric.org
트위터 트위터    페이스북 페이스북   유튜브 유튜브    RSS서비스 RSS
머크