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질문 mega프로그램으로 tree그리는 질문 입니다.
알songalac  |  2008.03.21 12:20
안녕하세요~ 저는 환경미생물쪽 트리를 그리려고 하는데요
프로그램 사용법을 잘 몰라 질문 드립니다.
NCBI BLAST DB에서 sequence를 찾았고, clustalx에서 sequence를 모아 fasta와 mega파일로 저장하여 phylogeny tree를 그렸습니다.
처음엔 sequence를 모아서 alinment를 실행하였고, 두번째는 *표시 서열들만 모아서 phylogeny를 실행해 봤습니다.
그런데 처음의 경우는 밴드결과와 조사한 시퀀스들의 위치가 서로 잘 안맞는것 같고, 두번째의 경우는 phylogeny를 실행할 때 마다 트리 모양이 계속 바뀌네요~
결과물을 첨부파일로 올리려고 했는데 첨부가 안되서 이렇게 글로써 문의 드립니다.
고수님들의 조언 좀 부탁 드립니다.
#mega
 
# tree
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