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 전체 > Molecular Biology-Protein > Western Blot Analysis
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질문 Western 실험 재시도시 signal이 안뜨는 문제
개구리스팸한조각  | 2016.03.28 15:47
보통 Protein extraction후에 단백질 cooking을 하는데, Western blot을 3회정도 할수 있을 분량을 cooking하거든요. 그 sample을 가지고 western blot을 하면 처음에는 signal이 잘뜨는데, 다시 재현실험을 하면 signal이 뜨질 않습니다...하나도요.. 왜이러는 걸까요?
#cooking
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
대왕개구리강시  |  2016.03.28   
cooking이란게 boiling 한다는 의미죠?
단백질 시료에 dye를 넣고 boiling 해서 냉동보관하면 상당기간 보관할 수 있습니다.
그런데 다시 실험하느라 시료를 젤에 로딩하면, 특히 spin down해서 loading하면 대상 단백질이 가라앉아서 보이지 않는 경우가 있습니다.
그래서 보통은 보관해뒀던 시료를 꺼내면 얼린것을 풀어서 스핀다운하고 파이펫팅으로 가라앉은것을 다시 잘 풀어준 다음 젤레 로딩합니다.
그런 경우도 생각해 보세요.

보통 웨스턴 할때 마커와 extraction한 시료, 완전 정제한 시료 등과 함께 whole cell extract도 함께 걸지요. WCE에서 시그날이 나오는데 정제된 시료에서 시그널이 안나오면 위의 설명처럼 된 경우입니다. WCE를 포함해서 모든 시료에서 시그널이 안나오면 항체가 맛이 갔거나 웨스턴 반응에 문제가 있는 거구요.
개구리스팸한조각  |  2016.03.30   
보통 녹인후에 파이페팅 안하고 바로 따서 로딩 했는데 그래서 그런걸까 생각도 드네요.

그리고 하나더 궁금한게 WCE와 정제한 시료의 차이는 boiling의 유무 차이인가요???

아니면 RIPA buffer로 cell을 깨준후에 상층액만 딴 것을 정제한 시료라고 부르는건가요???
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