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프라이머 위치가 어떤지 모르겠지만 gDNA size가 뜨는 primer는 아마 intron을 인식해서 일 것 같습니다. 16쌍의 프라이머가 각각 다른 gene인지 아니면 하나의 gene을 test하기 위해 16개나 짠것인지 모르겠지만 전자라면 다시 짜시고 후자라면 원하는 size만 specific하게 뜨는 primer를 쓰면 될 것 같네요.
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레벨5
seraphina
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16.03.23 11:42
gDNa size의 밴드가 나타나는거라면
원하는 밴드 말고 더 무거운 부분에서 뜬다는 말씀이신거죠?
프라이머 마다 specificity가 다릅니다
NCBI에서 primer blast 해보면 그 프라이머가 어떤 유전자를 증폭시킬수 있는지가 나옵니다.
좋은 프라이머의 경우 원하는 부분에가서 붙어 증폭이 되지만
특이성이 적은 프라이머의 경우 여러 유전자를 증폭시킵니다.
DNase는 사용하지 않아도 무방합니다.
저희 랩에서도 역시 DNase사용하지 않는 cDNA합성 키트를 사용하는데,
전혀 문제 없었습니다.
프라이머의 가능성이 가장 큰것으로 보입니다.