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우선 한번 씨퀀싱을 하신 것 같군요...
씨퀀싱에도 에러가 있습니다.
그래서 씨퀀싱을 할때는 두번정도 읽는 것이 좋습니다.
그리고 클로닝과정중에 특히 UV아래에서 Gel을 자를때 뮤테이션이 일어나기도 합니다.
이때 뮤테이션이 일어난 것일수도 있습니다.
끝으로 판매하는 벡터의 특허등의 문제로 특정 씨퀀스를 바꾸는 경우도 있습니다.
그러나 씨퀀스가 한개 바뀌어도 단백질에서 변화가 없다면 괜찮습니다.
...지나가다가 허접한 답변하나 달아봅니다.