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질문 miRNA realtime PCR 하기 위한 Probe 선택방법 문의 드립니다.
초보  |  2015.08.06 00:26
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)

miRNA를 사용하여 realtime PCR 하려고합니다.

ABI에서 probe를 주문하여 사용하려고 하는데요, 

ABI에서 검색시, 예를 들어 human mir-155를 검색하면, hs-mir-155-3p or hs-mir-155-5p

이렇게 3p와 5p가 붙어 나오게 됩니다. 검색 중에 이렇게 프라임이 붙는다는게 불완전 하기 때문에 

그렇다고 하는데, 이럴 경우에 어떻게 microRNA를 선택 해야 되는지 좀 알려주세요 ㅠㅠ

또한, 3p가 붙는 것은 그냥 specific하게 종이 human만 나오는데, 5p는 여러개의 miRBase ID와

많은 species를 나타내는데요, 이럴 경우에 어떤 microRNA를 선택하는 것이 좋은지 알려주세요..  


miRNA를 완전 처음 하기 때문에 많은 어려움이있네요... 도움 주시면 감사하겠습니다!!!!!!!ㅠ.ㅠ
#miRNA
 
#microRNA
 
#realtimePCR
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
지나가던 학생  |  2015.08.07    
miRbase에 들어가셔서 원하는 microRNA의 sequence와 ABI에서 검색해서 나온 miR의 sequnece가 일치하는지 확인해보시고 결정하시면 될 것 같습니다.

실험을 하려고 하시는 sample이 human이라면 hsa-miR-155 를 선택하시면 됩니다.
내가 보려고 하는 종 뿐만아니라 다른 종이 포함되어 있다고 해서 문제가 되진 않는다고 알고 있습니다.


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