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결과 받으셨을 때 그래프 같은 것(크로마토그램)도 같이 오죠?
그걸 열어보시고 첨부해주신 사진과 같이 alignment 되었을 때
Forward 방향과 Reverse 방향이 서로 다른 site에 대해서
더 명확하게 구분되는 sequecne로 결정하면 됩니다.
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레벨2
유전방입문자
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15.07.17 18:23
저는 sequencher라는 프로그램을 이용하여
크로마토그래피의 피크 상태를 보고 결과 상태를 확인합니다.
보통 서열의 길이가 길경우에 forward 와 reverse primer를 둘다 사용하여 양쪽에서 sequencing을 하게되는데~
결과는 크로마토그래피의 피크를 확인하여 서열을 결정하시면 될 것 같습니다.
예로들어서 결과의 상태가 안좋을 경우에 하나의 염기 피크에 (A=빨강색) 다른 염기의 피크가 포함되는 경우가 있습니다.
답변 너무 감사드립니다
제가 전공자도 아니고 설명을 들어도 너무 어려워서 ㅜㅜ다시 이렇게 질문드립니다.
R을 reverse complement를 하고 난 후 F-R 염기서열 정리할 때 R의 크로마토그래피를 결과 값이랑 어떻게 비교를 해야하는지,,혹시 몰라 사진 올립니다 ㅜㅜ 자세한 설명좀 부탁드릴게요
miniminim87@naver.com
다들 너무 감사드립니다 ^^*
메일 받고 도움 많이 되었습니다.^^