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질문 염기서열 분석 결과 질문입니다 ㅜㅜ도와주세요
초보자  |  2015.07.17 17:49
답변있는 질문은 수정/삭제 불가(☞문의)
첨부파일 파일첨부: S.JPG (75 KB)
이미지 첨부파일
업체에서 시퀀싱 의뢰 결과를 받고 분석하고 정리하는 것을 몰라 이렇게 올립니다 ㅜㅜ

제가 궁금한 점은

의뢰할 때 forward와 reverse를 의뢰하여 결과를 한 유전자 당 두가지를 받아보는데

site를 이용하여 reverse는 complement를 하여 forward와 reverse를 다음사진 까지는 정리를 할 수 있습니다.

사진을 보고 유전자 당 하나의 염기서열로 정리를 하고 싶은데 도무지 어떻게 하는 것인지 ㅜㅜ

의뢰할 때 그래프 같은 것도 같이 오는데 그거 보는 방법도 잘 모르겠고 ㅜㅜ 도와주세요 제발
#염기서열
 
#시퀀싱
 
#분석
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답변 본 정보는 네티즌에 의해 작성된 정보로, 내용 중 중요하다고 생각되는 부분은 추가적인 사실 확인을 반드시 하시길 바랍니다.
개구리별숲  |  2015.07.17   
결과 받으셨을 때 그래프 같은 것(크로마토그램)도 같이 오죠?
그걸 열어보시고 첨부해주신 사진과 같이 alignment 되었을 때 
Forward 방향과 Reverse 방향이 서로 다른 site에 대해서 
더 명확하게 구분되는 sequecne로 결정하면 됩니다.
올챙이유전방입문자  |  2015.07.17   

저는 sequencher라는 프로그램을 이용하여
크로마토그래피의 피크 상태를 보고 결과 상태를 확인합니다.
보통 서열의 길이가 길경우에 forward 와 reverse primer를 둘다 사용하여 양쪽에서 sequencing을 하게되는데~
결과는 크로마토그래피의 피크를 확인하여 서열을 결정하시면 될 것 같습니다.
예로들어서 결과의 상태가 안좋을 경우에 하나의 염기 피크에 (A=빨강색) 다른 염기의 피크가 포함되는 경우가 있습니다.

초보자  |  2015.07.19    
첨부파일 파일첨부: 1.hwp (544 KB)

답변 너무 감사드립니다
제가 전공자도 아니고 설명을 들어도 너무 어려워서 ㅜㅜ다시 이렇게 질문드립니다.
R을 reverse complement를 하고 난 후  F-R 염기서열 정리할 때 R의 크로마토그래피를 결과 값이랑 어떻게 비교를 해야하는지,,혹시 몰라 사진 올립니다 ㅜㅜ 자세한 설명좀 부탁드릴게요

miniminim87@naver.com

초보자  |  2015.07.21    



다들 너무 감사드립니다 ^^*

메일 받고 도움 많이 되었습니다.^^

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